More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1422 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2845  transcriptional regulator, GntR family  47.47 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  35.85 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  37.98 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 229 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 233 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  98.6  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  34.74 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 233 aa  95.5  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 284 aa  95.1  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 243 aa  94.7  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 233 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 239 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  33.49 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 254 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 217 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 239 aa  91.3  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1708  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 290 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 248 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 243 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>