282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1355 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  100 
 
 
348 aa  691    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  63.91 
 
 
337 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  63.93 
 
 
340 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  64.12 
 
 
340 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  64.14 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  51.34 
 
 
342 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  48.24 
 
 
366 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  50.16 
 
 
332 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  46.61 
 
 
352 aa  238  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  38.02 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  37.72 
 
 
346 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  34.8 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  35.22 
 
 
353 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  35.51 
 
 
366 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  41.36 
 
 
368 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  38.24 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  37.61 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  31.64 
 
 
338 aa  179  9e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  34.62 
 
 
341 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  35.42 
 
 
341 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  34.73 
 
 
353 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  34.44 
 
 
378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  38.11 
 
 
328 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  30.82 
 
 
326 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  39.26 
 
 
327 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  35.67 
 
 
322 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  35.05 
 
 
324 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  39.26 
 
 
327 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  38.72 
 
 
327 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  34.56 
 
 
354 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  36.01 
 
 
341 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  35.82 
 
 
332 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  36.01 
 
 
341 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  36.01 
 
 
341 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  36.01 
 
 
341 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  36.01 
 
 
341 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  36.01 
 
 
341 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  36.01 
 
 
341 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  33.65 
 
 
331 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  35.51 
 
 
351 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  35.88 
 
 
357 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  35.14 
 
 
325 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  33.33 
 
 
331 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  34.48 
 
 
332 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  33.33 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  33.33 
 
 
331 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  33.33 
 
 
331 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  38.25 
 
 
322 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  33.93 
 
 
341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  34.36 
 
 
315 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  30.4 
 
 
326 aa  165  9e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  33.02 
 
 
331 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  33.02 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  35.29 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  32.3 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0534  adenosine deaminase  37.88 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.125477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  37.16 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  34.64 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  33.02 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  33.02 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  36.16 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  35.67 
 
 
322 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  36.47 
 
 
341 aa  162  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  32.74 
 
 
337 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  34.28 
 
 
332 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4085  adenosine deaminase  38.07 
 
 
330 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  34.82 
 
 
341 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  34.5 
 
 
339 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  32.66 
 
 
361 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  33.91 
 
 
346 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  35.12 
 
 
682 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  35.12 
 
 
682 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  35.12 
 
 
341 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  33.96 
 
 
335 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  28.91 
 
 
335 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  27.86 
 
 
330 aa  159  5e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  31.56 
 
 
343 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  33.84 
 
 
334 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  33.84 
 
 
334 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  32.42 
 
 
317 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  34.2 
 
 
339 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  37.39 
 
 
328 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  32.39 
 
 
331 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  30.61 
 
 
337 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  32.1 
 
 
316 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  33.62 
 
 
356 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  30.84 
 
 
335 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  32.56 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  31.89 
 
 
316 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  35.22 
 
 
337 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  34.41 
 
 
349 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  34.12 
 
 
325 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  33.84 
 
 
345 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  35.55 
 
 
337 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  33.43 
 
 
341 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  32.85 
 
 
346 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  31.76 
 
 
365 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  32.55 
 
 
355 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  32.12 
 
 
317 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  32.82 
 
 
360 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>