More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1341 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  100 
 
 
315 aa  636    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  69.43 
 
 
331 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  67.62 
 
 
342 aa  425  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  65.51 
 
 
346 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  64.33 
 
 
323 aa  418  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  64.78 
 
 
328 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  64.78 
 
 
328 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  64.78 
 
 
328 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  65.92 
 
 
324 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  65.92 
 
 
322 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  64.2 
 
 
328 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  64.33 
 
 
324 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  64.33 
 
 
322 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  59.63 
 
 
337 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  55.41 
 
 
320 aa  355  5e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  54.46 
 
 
318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  48.01 
 
 
290 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  45.24 
 
 
292 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  48.38 
 
 
290 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  44.83 
 
 
290 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  45.17 
 
 
290 aa  235  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  46.93 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  44.14 
 
 
290 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  44.14 
 
 
290 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  44.14 
 
 
290 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  46.57 
 
 
290 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  46.57 
 
 
290 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  44.14 
 
 
290 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  44.14 
 
 
290 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  44.14 
 
 
290 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  43.79 
 
 
337 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  46.57 
 
 
290 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  43.84 
 
 
292 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  40.89 
 
 
286 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  40.62 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  41.86 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  41.11 
 
 
290 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  38.7 
 
 
292 aa  192  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  39.87 
 
 
288 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  38.67 
 
 
288 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  39.26 
 
 
286 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  39.6 
 
 
286 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  39.26 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  39.26 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  39.26 
 
 
286 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  38.39 
 
 
303 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  38.78 
 
 
288 aa  189  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  37.54 
 
 
288 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  37.54 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  38.33 
 
 
290 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  36.82 
 
 
287 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  38.36 
 
 
293 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  38.56 
 
 
301 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  38.26 
 
 
288 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  35.37 
 
 
293 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  38.26 
 
 
288 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  38.26 
 
 
288 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  36.86 
 
 
288 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  36.99 
 
 
289 aa  186  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  36.99 
 
 
289 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  36.99 
 
 
289 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  42.39 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39 
 
 
293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  39.36 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  39.01 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  40.36 
 
 
286 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  37.54 
 
 
288 aa  182  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  36.22 
 
 
296 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  38.36 
 
 
293 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  40.27 
 
 
283 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  36.66 
 
 
303 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  34.14 
 
 
289 aa  181  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  38.99 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  38.97 
 
 
274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  36.71 
 
 
288 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  34.82 
 
 
301 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  44.63 
 
 
283 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  37.85 
 
 
288 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  39.16 
 
 
288 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  36.58 
 
 
301 aa  177  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  39.86 
 
 
285 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  38.11 
 
 
288 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  38.11 
 
 
288 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  37.89 
 
 
288 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  38.11 
 
 
288 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  38.11 
 
 
288 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  38.11 
 
 
288 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  34.93 
 
 
293 aa  175  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  38.76 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  36.82 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  38.33 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  40 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  36.08 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  37.41 
 
 
283 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2491  Pirin domain protein  38.11 
 
 
277 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  37.41 
 
 
295 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  34.87 
 
 
302 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  34.98 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  38.98 
 
 
299 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  37.41 
 
 
295 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>