More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1292 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  100 
 
 
226 aa  431  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  58.45 
 
 
228 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  60.49 
 
 
242 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  60.98 
 
 
223 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  60 
 
 
210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  55.72 
 
 
219 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  49.26 
 
 
210 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  42.04 
 
 
254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  37.83 
 
 
248 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
268 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  42.4 
 
 
234 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  41.09 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  35.59 
 
 
233 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  39.91 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  34.88 
 
 
244 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  38.81 
 
 
242 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 
233 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  37.39 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  37.39 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  32.3 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  34.96 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.62 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  27.54 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  38.13 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  28.64 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
261 aa  71.6  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.06 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  35.66 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  23.81 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  33.1 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
273 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  33.57 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.03 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
268 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  34.04 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.5 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1057  transcriptional regulator, IclR family  37.23 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  28.1 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  31.37 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  35.81 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
275 aa  65.1  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
250 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  28.51 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
283 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6621  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  35.82 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  23.43 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  34 
 
 
550 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0373  transcriptional regulator, IclR family  30.46 
 
 
274 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.12 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>