163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1230 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  41.34 
 
 		 308 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  43.84 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  37.97 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  44.19 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  36.23 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  36.43 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  32.01 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  43.97 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  33.93 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  35.14 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  34.78 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  35.54 
 
 		 277 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  27.05 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  38.42 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  35.38 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  29.68 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  38.42 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  35.38 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  35.41 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  35.71 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  30.97 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  21.02 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  37.21 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  32.53 
 
 		 305 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  27.55 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  30.77 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  27.82 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  29.45 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  32.54 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  32.21 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  27.4 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  27.31 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  26.94 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  37.05 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  34.02 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  28.78 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  31.19 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  22.17 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  22.49 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  24.78 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  33.94 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  33.94 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  34.86 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  33.94 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  33.94 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  33.94 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  31.2 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.1 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  42.86 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  34.43 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  39.51 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  33.33 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.84 
 
 		 370 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  32.41 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 352 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.62 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0492  alpha/beta hydrolase fold  41.82 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0477  twin-arginine translocation pathway signal  36.7 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5781  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00627782  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.62 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.62 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  31.67 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.91 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.27 
 
 		 370 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  29.03 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  31.19 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  36.11 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  44.12 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>