85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1204 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 
262 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  35.37 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  37.28 
 
 
249 aa  92.4  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  35.37 
 
 
256 aa  92  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  32.55 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  34.36 
 
 
235 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  35.37 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  35.37 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  35.37 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  35.37 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.37 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  35.37 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2602  murein peptide amidase A  34.71 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  35.37 
 
 
242 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2320  murein peptide amidase A  34.71 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.836285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  35.37 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  34.76 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  34.76 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  34.76 
 
 
242 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  35.37 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  34.76 
 
 
242 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  34.76 
 
 
242 aa  84.7  1e-15  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  34.15 
 
 
237 aa  83.6  3e-15  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001003  gamma-D-Glutamyl-meso-Diaminopimelate Amidase  31.9 
 
 
236 aa  79.3  6e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.57 
 
 
218 aa  76.3  4e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07057  murein peptide amidase A  30.67 
 
 
248 aa  74.3  2e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 
1034 aa  73.6  3e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.2 
 
 
1074 aa  72.8  5e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.84 
 
 
1034 aa  70.5  3e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  31.58 
 
 
351 aa  70.1  3e-11  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.91 
 
 
315 aa  68.6  1e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.47 
 
 
384 aa  68.2  1e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.3 
 
 
453 aa  66.2  6e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.48 
 
 
378 aa  64.7  1e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.5 
 
 
500 aa  62.8  6e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.41 
 
 
379 aa  62  1e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.62 
 
 
304 aa  61.2  2e-08  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.8 
 
 
406 aa  60.1  4e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.58618e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.32 
 
 
428 aa  59.3  6e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.39 
 
 
424 aa  58.9  7e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  30.32 
 
 
879 aa  58.9  9e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.34 
 
 
497 aa  57.4  2e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  30 
 
 
440 aa  57  3e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  32.62 
 
 
821 aa  56.2  6e-07  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.38 
 
 
432 aa  55.8  8e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  26.71 
 
 
490 aa  54.7  1e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0782  hypothetical protein  27.66 
 
 
514 aa  55.5  1e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.84486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.72 
 
 
365 aa  53.9  2e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.26 
 
 
557 aa  54.3  2e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  33.66 
 
 
392 aa  53.9  3e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  25.32 
 
 
1067 aa  53.1  5e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.34 
 
 
432 aa  52  9e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  27.5 
 
 
388 aa  52  1e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0781  peptidase M14 carboxypeptidase A  55 
 
 
563 aa  51.6  1e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  60.53 
 
 
241 aa  51.2  2e-05  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  unclonable  1.87913e-05 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.29 
 
 
615 aa  50.8  2e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.12 
 
 
628 aa  50.4  3e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.3 
 
 
563 aa  49.7  4e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  1.96465e-06 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.31 
 
 
405 aa  49.7  5e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.15 
 
 
361 aa  49.3  6e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.57 
 
 
626 aa  48.5  9e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.77 
 
 
506 aa  48.9  9e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  22.35 
 
 
423 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2126  peptidase M14 carboxypeptidase A  41.07 
 
 
619 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.71 
 
 
889 aa  45.8  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.37 
 
 
559 aa  45.8  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  30.84 
 
 
364 aa  45.4  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  26.56 
 
 
840 aa  45.4  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.25 
 
 
422 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.11 
 
 
446 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  28.4 
 
 
403 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  27.33 
 
 
429 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.78 
 
 
400 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.46 
 
 
618 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  24.83 
 
 
293 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  30.93 
 
 
490 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  29.45 
 
 
606 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.25 
 
 
406 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  41.07 
 
 
568 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  41.07 
 
 
558 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  24.83 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  33.33 
 
 
426 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.29 
 
 
553 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  35.94 
 
 
259 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.5 
 
 
439 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>