115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1161 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  100 
 
 		 580 aa  1164    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  37.98 
 
 		 776 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  36.16 
 
 		 690 aa  303  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  34.67 
 
 		 847 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  38.08 
 
 		 620 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  33.02 
 
 		 550 aa  289  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0991  VanW family protein  35 
 
 		 1016 aa  283  7.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  35.15 
 
 		 748 aa  279  9e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  34.77 
 
 		 765 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  37.06 
 
 		 772 aa  270  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  34.93 
 
 		 580 aa  257  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  34.22 
 
 		 608 aa  256  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  34.42 
 
 		 582 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  33.22 
 
 		 604 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  34.64 
 
 		 576 aa  242  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  31.02 
 
 		 892 aa  242  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4909  VanW family protein  32.17 
 
 		 633 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  31.56 
 
 		 682 aa  229  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  32.78 
 
 		 559 aa  225  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  32.97 
 
 		 567 aa  221  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0758  VanW family protein  34.33 
 
 		 1355 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.115824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2825  putative vancomycin resistance protein  30.28 
 
 		 652 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  30.24 
 
 		 636 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  26.22 
 
 		 670 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  28.51 
 
 		 636 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  27.7 
 
 		 633 aa  153  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  26.48 
 
 		 686 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  25.77 
 
 		 675 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  32.23 
 
 		 436 aa  137  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  30.15 
 
 		 569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  35.06 
 
 		 738 aa  133  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  26.67 
 
 		 591 aa  131  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  29.43 
 
 		 503 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  27.51 
 
 		 594 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  28.35 
 
 		 491 aa  126  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  28.61 
 
 		 510 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  28.01 
 
 		 569 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  35.2 
 
 		 520 aa  117  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  31.51 
 
 		 467 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  27.98 
 
 		 491 aa  114  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  27.4 
 
 		 677 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  31.36 
 
 		 458 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  26.11 
 
 		 591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  25.74 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  35.57 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1425  VanW family protein  23.24 
 
 		 617 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  32.23 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  24.34 
 
 		 781 aa  105  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  33.91 
 
 		 565 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  33.33 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  35.14 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  28.09 
 
 		 456 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  36 
 
 		 481 aa  94  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  33.68 
 
 		 219 aa  94  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  26.96 
 
 		 579 aa  92.8  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  25.87 
 
 		 520 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  38.24 
 
 		 373 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  36.31 
 
 		 600 aa  90.5  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  37.4 
 
 		 642 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  36.23 
 
 		 489 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38770  hypothetical protein  29.73 
 
 		 415 aa  89.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  27.44 
 
 		 518 aa  88.6  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  28.36 
 
 		 319 aa  87.8  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  36.84 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  39.45 
 
 		 248 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  28.04 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  36.36 
 
 		 366 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  36.96 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  24.69 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  24.69 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  24.69 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  32.52 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  29.57 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  24.69 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  24.69 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  24.69 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  24.69 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  31.9 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  43.27 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  43.27 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  43.27 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  43.27 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  43.27 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  43.27 
 
 		 303 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  43.27 
 
 		 303 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  43.27 
 
 		 303 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  43.27 
 
 		 303 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  43.27 
 
 		 303 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  43.27 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  25.23 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  27.47 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  36.52 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  27.84 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  32.31 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  35.11 
 
 		 439 aa  79.7  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  36.45 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  34.78 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  27.33 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5507  VanW family protein  29.46 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.170032 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  34.45 
 
 		 450 aa  73.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>