60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1146 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1146  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  236  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.817406  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  47.22 
 
 
111 aa  97.8  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  51.82 
 
 
129 aa  95.9  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  46 
 
 
120 aa  90.1  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  46.85 
 
 
121 aa  86.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6525  hypothetical protein  45.87 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  44.34 
 
 
115 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  51.69 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5846  hypothetical protein  53.57 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.434453 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0151  protein of unknown function DUF202  45.22 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3058  protein of unknown function DUF202  53.06 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  45.71 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  45.71 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  45.71 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12890  predicted membrane protein  44.44 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0074  hypothetical protein  45.45 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  53.85 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  46.09 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  55.7 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  48.54 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0500  protein of unknown function DUF202  49.04 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2741  hypothetical protein  42.28 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2202  hypothetical protein  54.88 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2302  protein of unknown function DUF202  53.33 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  43.56 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  43.56 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.316723 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  43.56 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  43.56 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  43.56 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  43.56 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  43.56 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  43.56 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  43.56 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.783904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1719  hypothetical protein  51.81 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  48.78 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4135  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  48.78 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3719  protein of unknown function DUF202  54.55 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  48.78 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  48.78 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  46.51 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04300  predicted membrane protein  56.44 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1527  protein of unknown function DUF202  44.14 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2929  hypothetical protein  50.46 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3966  protein of unknown function DUF202  44.86 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  48.42 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  47.67 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0171  hypothetical protein  40.74 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  43.75 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3153  hypothetical protein  49.41 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26250  predicted membrane protein  44.14 
 
 
121 aa  60.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  61.7 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5393  protein of unknown function DUF202  46.94 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12298  transmembrane protein  50.6 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2740  protein of unknown function DUF202  43.37 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000277057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  33.62 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  25.6 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  37.62 
 
 
131 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  58.62 
 
 
217 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>