251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1055 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  100 
 
 		 254 aa  494  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  60.36 
 
 		 221 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  57.87 
 
 		 268 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  56.56 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  55.35 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  49.8 
 
 		 274 aa  241  9e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  54.59 
 
 		 366 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  56.68 
 
 		 224 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  55.56 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  50.46 
 
 		 262 aa  225  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  51.57 
 
 		 225 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  49.8 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  51.17 
 
 		 246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  50.93 
 
 		 243 aa  218  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  50.64 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  50.47 
 
 		 218 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  47.91 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  45.83 
 
 		 305 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  42.62 
 
 		 270 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  43.98 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  44.12 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  43.64 
 
 		 243 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  41.74 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  41.63 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  41.63 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  41.63 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  47.37 
 
 		 239 aa  175  7e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  41.28 
 
 		 225 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  45.95 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  40.97 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  36.33 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  44.55 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  45.03 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  41.52 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  38.21 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  45.77 
 
 		 217 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  40.57 
 
 		 200 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  43.93 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  39.3 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  38.98 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  37.79 
 
 		 215 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  43.69 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  43.69 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  37.67 
 
 		 215 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  37.67 
 
 		 215 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  37.73 
 
 		 215 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  36.11 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  38.14 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  38.14 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  35.65 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  35.51 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  35.05 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  35.05 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  34.58 
 
 		 215 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  39.17 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  39.25 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  39.38 
 
 		 218 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  36.49 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  32.39 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  32.39 
 
 		 215 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  37.31 
 
 		 195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  37.31 
 
 		 195 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  33.92 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  36.32 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  36.55 
 
 		 192 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  34.66 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  33.81 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  35.35 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  40.1 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  39.51 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  34.48 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  34.04 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  38.02 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  34.66 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  31.92 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  31.78 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  33.68 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  31.49 
 
 		 209 aa  92.4  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  34.83 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  34.33 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  30.99 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  30.66 
 
 		 205 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  33.51 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  28.77 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  31.52 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  32.97 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  30.66 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  31.52 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  31.6 
 
 		 205 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  31.52 
 
 		 227 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  31.82 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  31.43 
 
 		 215 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  28.33 
 
 		 227 aa  85.5  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  28.3 
 
 		 208 aa  85.5  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  31.43 
 
 		 236 aa  85.5  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  32.7 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  30.05 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  31.07 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  32.23 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1319  hemolysin III, putative  28.41 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>