More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0885 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  802    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 417 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 410 aa  255  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  37.56 
 
 		 418 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  34.09 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 435 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 459 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 432 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 420 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 409 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  30.69 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.12 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  32.48 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.94 
 
 		 420 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  25.41 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.71 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.71 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.47 
 
 		 420 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  25 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 420 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25.37 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.83 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  31.25 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  28.5 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0867  putative membrane transport protein  32.81 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4530  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.05 
 
 		 1833 aa  90.5  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4617  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 455 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  hitchhiker  0.000601374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  28.08 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  28.08 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2440  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 		 424 aa  87.4  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 450 aa  86.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 442 aa  86.7  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  25.62 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  30.1 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.49 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  26.92 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.35 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  27.15 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0029  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  25.3 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  24.68 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  23.36 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  29.54 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4777  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881248  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  26.72 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  29.49 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1603  putative permease  29.59 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2819  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 462 aa  73.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000630163  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  28.52 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 499 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  28.16 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>