More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0851 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 396 aa  791    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  30.42 
 
 		 414 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 413 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  30.6 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  30.18 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  30.55 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 		 391 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  30.83 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  30.83 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  29.91 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  30.67 
 
 		 395 aa  132  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  29.36 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 		 412 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  29.65 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  28.83 
 
 		 395 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 		 390 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.13 
 
 		 399 aa  126  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  27.7 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  28.57 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  28.38 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  28.77 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 390 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 		 392 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  28.08 
 
 		 390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  27.06 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 		 390 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  30.65 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  26.55 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 		 390 aa  113  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4821  putative ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  28.68 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 		 402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  26.89 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  25.98 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.33 
 
 		 415 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  24.57 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  28.66 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 390 aa  106  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3805  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0795418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  24.35 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 390 aa  103  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.11 
 
 		 376 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  24.77 
 
 		 391 aa  99.8  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 415 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  24.04 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.15 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0549  extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 413 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6461  Extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 		 402 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3891  extracellular ligand-binding receptor  29.7 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2747  putative periplasmic substrate-binding protein  28.95 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0572  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.95 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2434  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.95 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00891241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1756  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.95 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2846  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.95 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  28.95 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0008  extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0939525  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  32.08 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  27.43 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3849  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  26.75 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.23 
 
 		 467 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  27.43 
 
 		 405 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>