266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0814 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  65.12 
 
 		 875 aa  1087    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  49.09 
 
 		 779 aa  686    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  63.68 
 
 		 871 aa  1075    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  48.74 
 
 		 811 aa  685    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  65.42 
 
 		 856 aa  1095    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  66.35 
 
 		 881 aa  1078    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  69.17 
 
 		 863 aa  1157    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  48.57 
 
 		 826 aa  683    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  62.32 
 
 		 838 aa  996    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  64.42 
 
 		 899 aa  1069    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  47.98 
 
 		 820 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  66.04 
 
 		 859 aa  1117    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  49.02 
 
 		 792 aa  707    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  63.42 
 
 		 860 aa  1028    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  65.4 
 
 		 867 aa  1100    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  66.67 
 
 		 859 aa  1104    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  66.51 
 
 		 872 aa  1115    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  64.45 
 
 		 884 aa  1029    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  100 
 
 		 842 aa  1707    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  65.79 
 
 		 852 aa  1108    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  81.66 
 
 		 841 aa  1390    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  63.81 
 
 		 836 aa  1053    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  66.04 
 
 		 859 aa  1117    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  66.75 
 
 		 859 aa  1110    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  67.38 
 
 		 857 aa  1134    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  66.04 
 
 		 859 aa  1117    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  66.27 
 
 		 859 aa  1103    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  49.1 
 
 		 800 aa  734    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  43.2 
 
 		 841 aa  614  9.999999999999999e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  67.71 
 
 		 944 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  43.92 
 
 		 757 aa  566  1e-160  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  61.5 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  61.27 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.55 
 
 		 741 aa  412  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  53.14 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.89 
 
 		 737 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.98 
 
 		 737 aa  388  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  50.39 
 
 		 418 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  51.42 
 
 		 435 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  45.92 
 
 		 392 aa  348  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  45.35 
 
 		 362 aa  327  7e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  46.4 
 
 		 419 aa  325  2e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  47.72 
 
 		 380 aa  322  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  43.71 
 
 		 359 aa  320  5e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  46.67 
 
 		 359 aa  319  1e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  46.67 
 
 		 359 aa  318  3e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  48.95 
 
 		 376 aa  317  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  45.61 
 
 		 370 aa  318  4e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.8 
 
 		 453 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  44.56 
 
 		 386 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  47.56 
 
 		 358 aa  299  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  45.04 
 
 		 381 aa  294  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.61 
 
 		 382 aa  294  5e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  44.02 
 
 		 367 aa  291  3e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  42.98 
 
 		 352 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  44.48 
 
 		 365 aa  287  5e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  43.66 
 
 		 352 aa  286  9e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  45.82 
 
 		 356 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  40.88 
 
 		 384 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  43.7 
 
 		 352 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  42.21 
 
 		 358 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  40.88 
 
 		 384 aa  283  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  43.53 
 
 		 380 aa  282  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  42.82 
 
 		 391 aa  281  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  41.91 
 
 		 362 aa  280  8e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  43.84 
 
 		 358 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  42.29 
 
 		 384 aa  276  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  40.35 
 
 		 390 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  43.36 
 
 		 376 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  42.2 
 
 		 366 aa  273  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  46.3 
 
 		 419 aa  272  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  42.56 
 
 		 398 aa  271  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  44.55 
 
 		 358 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  40.71 
 
 		 351 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  40.92 
 
 		 362 aa  267  5.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  43.55 
 
 		 386 aa  266  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  40.75 
 
 		 364 aa  264  4.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  41.98 
 
 		 565 aa  261  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  44.51 
 
 		 331 aa  259  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  43.03 
 
 		 329 aa  257  6e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  41.95 
 
 		 325 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  39.02 
 
 		 362 aa  254  6e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3326  FO synthase  40.78 
 
 		 372 aa  253  7e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.9768  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  37.71 
 
 		 356 aa  253  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  41.77 
 
 		 360 aa  252  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  37.46 
 
 		 361 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  40.41 
 
 		 321 aa  243  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  37.75 
 
 		 361 aa  242  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  40.11 
 
 		 387 aa  237  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  39.56 
 
 		 368 aa  237  8e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  41.42 
 
 		 327 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  38.54 
 
 		 389 aa  235  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  36.18 
 
 		 373 aa  233  8.000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  41.19 
 
 		 393 aa  229  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  37.29 
 
 		 359 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  39.45 
 
 		 373 aa  226  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  37.01 
 
 		 330 aa  224  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  40.71 
 
 		 372 aa  224  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  39.87 
 
 		 358 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  38.79 
 
 		 368 aa  221  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>