More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0809 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 206 aa  95.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 232 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 234 aa  91.7  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  36 
 
 		 209 aa  88.6  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  29.87 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  31.12 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
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NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  30.37 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  27.32 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  23.08 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  44.71 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  29.33 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  27.55 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
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NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
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NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
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NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  43.9 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
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