More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0754 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
291 aa  563  1e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  55.67 
 
 
327 aa  281  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  59.19 
 
 
318 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  53.7 
 
 
325 aa  254  9e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  50 
 
 
370 aa  243  2e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  47.24 
 
 
368 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  59.5 
 
 
217 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  58.46 
 
 
199 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  58.77 
 
 
235 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  62.07 
 
 
217 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  47.79 
 
 
191 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  54.69 
 
 
216 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  53.85 
 
 
207 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  56.59 
 
 
212 aa  134  1e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  52.94 
 
 
174 aa  135  1e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  56.9 
 
 
196 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  52.59 
 
 
438 aa  133  4e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  50.69 
 
 
206 aa  132  7e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  57.5 
 
 
244 aa  132  7e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  56.78 
 
 
206 aa  132  8e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  46.45 
 
 
211 aa  132  8e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  54.39 
 
 
228 aa  131  1e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  53.39 
 
 
280 aa  130  2e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.67564e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  54.1 
 
 
189 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  58.88 
 
 
202 aa  129  5e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  57.39 
 
 
270 aa  129  7e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  55.93 
 
 
237 aa  129  8e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  54.17 
 
 
243 aa  128  1e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  55.65 
 
 
242 aa  128  1e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  52 
 
 
261 aa  126  4e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  51.45 
 
 
224 aa  126  4e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  48.33 
 
 
305 aa  125  8e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  52.17 
 
 
197 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  50.72 
 
 
218 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  52.5 
 
 
195 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  48.31 
 
 
273 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  50.72 
 
 
197 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  59.81 
 
 
215 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  52.5 
 
 
202 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  54.47 
 
 
297 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  54.47 
 
 
297 aa  123  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  50.85 
 
 
204 aa  121  1e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  51.69 
 
 
202 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  52.25 
 
 
200 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  50.44 
 
 
283 aa  119  4e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  54.05 
 
 
222 aa  120  4e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  50 
 
 
204 aa  119  5e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  54.31 
 
 
328 aa  119  5e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 
362 aa  119  5e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  52.17 
 
 
198 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.27479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  50.42 
 
 
245 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  53.98 
 
 
226 aa  118  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  39.15 
 
 
204 aa  118  1e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  52.21 
 
 
329 aa  118  1e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  39.15 
 
 
204 aa  118  1e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
215 aa  118  1e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  49.37 
 
 
256 aa  117  2e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  52.94 
 
 
448 aa  117  2e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  50 
 
 
239 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  50.85 
 
 
203 aa  116  4e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  5.18233e-15  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  50.86 
 
 
204 aa  116  4e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  49.18 
 
 
247 aa  116  4e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  30.84 
 
 
259 aa  116  4e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  5.72163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
299 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
245 aa  116  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  52.99 
 
 
189 aa  116  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  50 
 
 
188 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  49.17 
 
 
239 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  49.17 
 
 
239 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  50.85 
 
 
242 aa  115  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  49.17 
 
 
146 aa  115  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  49.17 
 
 
239 aa  115  7e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  51.28 
 
 
217 aa  115  7e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  55.75 
 
 
280 aa  115  7e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  49.58 
 
 
216 aa  115  7e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  47.54 
 
 
199 aa  115  7e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  54.24 
 
 
304 aa  115  8e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
194 aa  115  8e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  51.38 
 
 
263 aa  115  8e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  53.45 
 
 
234 aa  114  1e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  29.69 
 
 
261 aa  115  1e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  47.4 
 
 
278 aa  114  2e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  48.33 
 
 
249 aa  114  2e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  48.33 
 
 
251 aa  114  2e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  48.31 
 
 
442 aa  114  2e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  29.61 
 
 
261 aa  114  2e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.65036e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  48.33 
 
 
251 aa  114  2e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  48.33 
 
 
251 aa  114  2e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  40.34 
 
 
261 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  40.34 
 
 
261 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.33422e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  40.34 
 
 
261 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  47.46 
 
 
281 aa  113  4e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.00876e-10  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  28.76 
 
 
261 aa  113  4e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  53.98 
 
 
362 aa  113  4e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  49.21 
 
 
218 aa  113  4e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  41.18 
 
 
261 aa  113  4e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.81259e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  40.34 
 
 
261 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  49.17 
 
 
208 aa  112  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  53.04 
 
 
271 aa  111  1e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  42.02 
 
 
238 aa  111  1e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  4.77614e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>