More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0739 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2315  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.35 
 
 
680 aa  786    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0546949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  65.38 
 
 
680 aa  845    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2007  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.03 
 
 
687 aa  712    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.877962  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31020  flagellar biosynthesis protein FlhA  59.43 
 
 
686 aa  748    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2972  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.23 
 
 
682 aa  685    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.78 
 
 
708 aa  773    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
681 aa  1329    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.57 
 
 
702 aa  788    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.48 
 
 
692 aa  624  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.78 
 
 
686 aa  612  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.14 
 
 
690 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.97 
 
 
695 aa  585  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.63 
 
 
690 aa  581  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4134  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.85 
 
 
688 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000385225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.69 
 
 
697 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0159  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.8 
 
 
676 aa  567  1e-160  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.533108  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.5 
 
 
693 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.53 
 
 
690 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.77 
 
 
697 aa  559  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.43 
 
 
696 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.76 
 
 
674 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.52 
 
 
694 aa  555  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.44 
 
 
694 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.31 
 
 
676 aa  549  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.72 
 
 
697 aa  550  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.99 
 
 
686 aa  549  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.91 
 
 
695 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.02 
 
 
699 aa  546  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1410  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.79 
 
 
682 aa  548  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.2 
 
 
692 aa  544  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.75 
 
 
692 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.22 
 
 
678 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.61 
 
 
706 aa  541  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.38 
 
 
689 aa  539  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.74 
 
 
708 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.1 
 
 
679 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.93 
 
 
702 aa  537  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.74 
 
 
708 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.22 
 
 
678 aa  538  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.99 
 
 
673 aa  538  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.75 
 
 
700 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.74 
 
 
695 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.8 
 
 
700 aa  537  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.75 
 
 
708 aa  538  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.73 
 
 
710 aa  537  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.55 
 
 
700 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0704  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.53 
 
 
688 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.55 
 
 
700 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.21 
 
 
700 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.55 
 
 
700 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.55 
 
 
700 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.14 
 
 
700 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.55 
 
 
700 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.55 
 
 
700 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.69 
 
 
700 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.21 
 
 
700 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.75 
 
 
700 aa  535  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.55 
 
 
700 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.67 
 
 
694 aa  531  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  45.78 
 
 
696 aa  529  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.92 
 
 
700 aa  530  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.87 
 
 
700 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.18 
 
 
699 aa  531  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0761  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.47 
 
 
696 aa  530  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417775  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.47 
 
 
693 aa  532  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.61 
 
 
698 aa  531  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.91 
 
 
692 aa  531  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.67 
 
 
694 aa  532  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3371  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.48 
 
 
699 aa  528  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029273  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.65 
 
 
700 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.52 
 
 
695 aa  527  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.76 
 
 
703 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2839  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.65 
 
 
700 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.65 
 
 
700 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.75 
 
 
699 aa  528  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.22 
 
 
696 aa  525  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.97 
 
 
693 aa  528  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.92 
 
 
690 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.11 
 
 
711 aa  525  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.67 
 
 
694 aa  525  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.86 
 
 
699 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.11 
 
 
693 aa  524  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.31 
 
 
699 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.31 
 
 
699 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1619  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.36 
 
 
700 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.24 
 
 
698 aa  524  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 
692 aa  520  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.02 
 
 
699 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.02 
 
 
699 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.57 
 
 
699 aa  521  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.02 
 
 
699 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.27 
 
 
699 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.86 
 
 
697 aa  521  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.45 
 
 
699 aa  522  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4344  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.08 
 
 
709 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.88 
 
 
699 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4141  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.58 
 
 
697 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.303073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2153  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.99 
 
 
678 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1398  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.35 
 
 
710 aa  515  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.76 
 
 
705 aa  513  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>