More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0730 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 374 aa  756    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  70.05 
 
 		 370 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  68.11 
 
 		 373 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  69.84 
 
 		 370 aa  529  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  70.05 
 
 		 376 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  67.91 
 
 		 373 aa  525  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  67.03 
 
 		 369 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  65.23 
 
 		 377 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  67.56 
 
 		 374 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  66.05 
 
 		 377 aa  501  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  63.64 
 
 		 376 aa  498  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  63.24 
 
 		 374 aa  498  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  64.59 
 
 		 375 aa  494  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  63.73 
 
 		 381 aa  495  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  67.65 
 
 		 374 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  65.5 
 
 		 370 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  63.3 
 
 		 376 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  65.68 
 
 		 375 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  62.83 
 
 		 371 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  63.61 
 
 		 376 aa  484  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  63.1 
 
 		 395 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  63.47 
 
 		 376 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  64.59 
 
 		 372 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  63.78 
 
 		 370 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  63.78 
 
 		 370 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  63.78 
 
 		 370 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  63.3 
 
 		 375 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  62.97 
 
 		 417 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  61.85 
 
 		 378 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  59.46 
 
 		 387 aa  435  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  62.43 
 
 		 369 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  58.99 
 
 		 379 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  55.61 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  62.33 
 
 		 385 aa  428  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  60.27 
 
 		 393 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  58.06 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  59.52 
 
 		 378 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  52.89 
 
 		 380 aa  403  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  44.86 
 
 		 373 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  29.82 
 
 		 383 aa  145  8.000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  27.12 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  24.79 
 
 		 361 aa  102  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  26.89 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  27.68 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  28.07 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  27.86 
 
 		 357 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  28.49 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  25.15 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  28.53 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  23.58 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  27.53 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  25.33 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  25.85 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  25.21 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  26.52 
 
 		 357 aa  86.3  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  25.95 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  25.85 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  24.87 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  25.57 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1962  phosphoserine aminotransferase  23.03 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  26.27 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  24.46 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  25.89 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  26.95 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  23.18 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  23.18 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  25.92 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  25.2 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1171  phosphoserine aminotransferase  23.83 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  24.21 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0477  phosphoserine aminotransferase  26.47 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108745 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2803  phosphoserine aminotransferase  25.86 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128725  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1203  phosphoserine aminotransferase  24.54 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2708  phosphoserine aminotransferase  25.86 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  25.95 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3317  phosphoserine aminotransferase  26.74 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  23.35 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  25.79 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  25.07 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  23.58 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  23.58 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  26.06 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  26.06 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3596  phosphoserine aminotransferase  25.8 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1687  phosphoserine aminotransferase  25.4 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  23.58 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  25.67 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2619  phosphoserine aminotransferase  24.21 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4790  phosphoserine aminotransferase  28.9 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1631  phosphoserine aminotransferase  25.4 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  25.14 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  21.15 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  23.37 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2969  phosphoserine aminotransferase  25.42 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  25.06 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0295  phosphoserine aminotransferase  22.93 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000953711  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  23.63 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  23.76 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  23.1 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>