More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0671 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  100 
 
 
127 aa  256  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  54.76 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  55.56 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  53.97 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  58.73 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  56.35 
 
 
138 aa  120  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  55.91 
 
 
142 aa  117  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  52.67 
 
 
142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  52.38 
 
 
141 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  51.18 
 
 
142 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  51.97 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  51.15 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  54.47 
 
 
142 aa  104  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  49.6 
 
 
142 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  50 
 
 
145 aa  104  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  50.79 
 
 
141 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  46.97 
 
 
133 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  52.94 
 
 
131 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  50 
 
 
142 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  44.96 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  50 
 
 
143 aa  95.9  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  49.18 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  47.93 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  44.09 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  46.83 
 
 
139 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  39.37 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  41.73 
 
 
343 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  41.73 
 
 
343 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  42.52 
 
 
343 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  41.73 
 
 
343 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  45.83 
 
 
339 aa  90.5  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  43.85 
 
 
157 aa  87  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  40.16 
 
 
343 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  42.15 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  45.26 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  42.64 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  40.68 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  42.4 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  40.48 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  41.8 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  34.13 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  38.32 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  40.48 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  36.51 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  40 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  40 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  36.89 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  45.45 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  45.45 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  45.45 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  37.96 
 
 
337 aa  67.8  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  42.5 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  35.77 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  41.25 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  44.29 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  53.73 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  36.54 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  37.4 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  36.54 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  40.24 
 
 
281 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  35.92 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  39.08 
 
 
284 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  34.96 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  40.24 
 
 
281 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  40.24 
 
 
281 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  40 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  41.77 
 
 
280 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  34.21 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  39.34 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  40 
 
 
282 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1536  hypothetical protein  33.94 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0187  dehydratase  33.94 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.771388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  33.98 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  44.29 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  35.78 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  34.74 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  42.57 
 
 
297 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  37.66 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  33.65 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  37.66 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  37.66 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  45.07 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  35.79 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  45.07 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 
620 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2926  putative MaoC-like dehydratase  40.85 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.997708  normal  0.0377556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  39.24 
 
 
285 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  43.66 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  36.04 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.19 
 
 
464 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  40.91 
 
 
288 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  30.56 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  41.33 
 
 
286 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  40.28 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3364  MaoC-like dehydratase  42.25 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.975509  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  37.93 
 
 
285 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 
470 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1221  MaoC domain protein dehydratase  41.89 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3597  dehydratase  41.67 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3661  dehydratase  42.25 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.831738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>