More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0619 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  659    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  48.93 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.26 
 
 		 314 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  53.51 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  47 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  42.63 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.63 
 
 		 301 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  45.86 
 
 		 318 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  50.76 
 
 		 291 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  44.36 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.45 
 
 		 290 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  45.08 
 
 		 294 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  45.08 
 
 		 294 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  39.61 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.18 
 
 		 287 aa  196  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  45.11 
 
 		 291 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  45.13 
 
 		 290 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  45.69 
 
 		 299 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.7 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.55 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  43.18 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  43.98 
 
 		 272 aa  172  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  46.51 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.78 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.66 
 
 		 291 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.48 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  38.82 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  45.36 
 
 		 309 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.2 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  33.86 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  33.86 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 		 285 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  33.07 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  32.68 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  33.59 
 
 		 284 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  33.2 
 
 		 284 aa  95.9  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  33.2 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  33.2 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  28.81 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  27.46 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  29.96 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  28.68 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  28.33 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.13 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  25.41 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  29.21 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  29.21 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  28.48 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  30.8 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  28.84 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  30.25 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  31.86 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  28.06 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.26 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  26.85 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  27.24 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  30.41 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  28.52 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  30.97 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  29.39 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  28.04 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13721  SMR family transporter  27.85 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.125485  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  27.7 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  29.52 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  28.41 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.32 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1280  SMR family transporter PecM  27.52 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  26.22 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.13 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  30.23 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 302 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  27.69 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  28.95 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  31.09 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.63 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  31.07 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  30.74 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  30.56 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.02 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  28.33 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  37.5 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  30.56 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  26.94 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  26.32 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 		 293 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  30.56 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  26.03 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  23.2 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  26.03 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.74 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  28.03 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>