160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0586 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  100 
 
 		 427 aa  865    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  31.67 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  28.03 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  30.82 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  30.3 
 
 		 431 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  28.81 
 
 		 480 aa  127  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4453  amine oxidase  28.04 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  26.19 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  26.5 
 
 		 496 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.67 
 
 		 454 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  26.73 
 
 		 496 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4436  amine oxidase  27.12 
 
 		 480 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511902  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  26.81 
 
 		 463 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  28.89 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  25.27 
 
 		 625 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.06 
 
 		 624 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  25.95 
 
 		 616 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.66 
 
 		 592 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  25.73 
 
 		 619 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  25.5 
 
 		 619 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  23.75 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  24.78 
 
 		 565 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  25.22 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  22.55 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  25.54 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  26.21 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  24.95 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  24.78 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  25.38 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  26.23 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  26.23 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  24.21 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  25.33 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  23.69 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  25.79 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  26.8 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  22.99 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  22.22 
 
 		 490 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  25.45 
 
 		 462 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  24.38 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  22.7 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  22.92 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  24.4 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  25 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  22.59 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  22.59 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  25.23 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  24.16 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  22.59 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  22.06 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  22.59 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  25 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  22.47 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  24.72 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  24.72 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  25.21 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  24.19 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  23.62 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  25.05 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  24.2 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  25.57 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  24.41 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  20.8 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  26.42 
 
 		 543 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  20.8 
 
 		 478 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  20.8 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  20.8 
 
 		 478 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  24.5 
 
 		 454 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  25.75 
 
 		 487 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  19.88 
 
 		 516 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  20.33 
 
 		 516 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  20.8 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  24.61 
 
 		 498 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  25.51 
 
 		 512 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  21.14 
 
 		 478 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  25.11 
 
 		 494 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  23.34 
 
 		 532 aa  53.5  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  24.71 
 
 		 624 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.26 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  28.11 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  24.17 
 
 		 1199 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  43.9 
 
 		 465 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  25.26 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  23.83 
 
 		 485 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  19.33 
 
 		 495 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  19.33 
 
 		 495 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  33.01 
 
 		 494 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  23.92 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  25.34 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  25.34 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  50 
 
 		 492 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  48.28 
 
 		 435 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  21.11 
 
 		 528 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  24.49 
 
 		 578 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 494 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  20.75 
 
 		 525 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  23.5 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  24.37 
 
 		 493 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  19.29 
 
 		 469 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>