12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0566 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0566  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  156  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3944  putative DNA-binding protein  50 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4453  hypothetical protein  46.15 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0558  hypothetical protein  48.28 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6842  phage transcriptional regulator, AlpA  42.59 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0350  hypothetical protein  45.28 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0600822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0079  phage transcriptional regulator AlpA  48.33 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.04332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0149  hypothetical protein  44.26 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8661  hypothetical protein  45.76 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0975  hypothetical protein  46.94 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0692  hypothetical protein  41.67 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7404  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>