54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0565 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  100 
 
 		 459 aa  923    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  46.78 
 
 		 456 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  43.53 
 
 		 454 aa  355  8.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  43.97 
 
 		 454 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  44.52 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  42.95 
 
 		 464 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  41.89 
 
 		 492 aa  327  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  40.86 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  39.75 
 
 		 477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  40.82 
 
 		 433 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0976  hypothetical protein  37.83 
 
 		 470 aa  273  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  47.29 
 
 		 283 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  46.02 
 
 		 226 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  46.4 
 
 		 114 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  53.75 
 
 		 104 aa  90.1  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  56.25 
 
 		 106 aa  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  53.25 
 
 		 89 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  59.02 
 
 		 66 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  30 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  30.32 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  28.41 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  28.78 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.78 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  27.01 
 
 		 354 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  22.81 
 
 		 392 aa  54.3  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  21.72 
 
 		 390 aa  53.5  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.39 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  26.01 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.18 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  25.55 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  24.71 
 
 		 635 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.41 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.44 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  28.99 
 
 		 566 aa  48.5  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.58 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  43.48 
 
 		 356 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  26.59 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2807  Phage integrase  24.81 
 
 		 323 aa  47  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  27.5 
 
 		 396 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1508  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.51 
 
 		 319 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25.62 
 
 		 370 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  23.83 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24.91 
 
 		 377 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  38.98 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  24.26 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  22.71 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.83 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0221  integrase domain protein SAM domain protein  28.57 
 
 		 223 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  31.62 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  23.93 
 
 		 362 aa  43.5  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.71 
 
 		 477 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  25.94 
 
 		 368 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  22.08 
 
 		 270 aa  43.1  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>