228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0564 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 		 163 aa  322  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  69.94 
 
 		 165 aa  237  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  69.33 
 
 		 163 aa  235  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  69.33 
 
 		 163 aa  233  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  68.1 
 
 		 165 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0858  protein of unknown function DUF520  70.37 
 
 		 163 aa  232  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83182  hitchhiker  0.00457625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  69.51 
 
 		 164 aa  231  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  67.48 
 
 		 163 aa  230  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  66.26 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  66.26 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  66.26 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  65.64 
 
 		 163 aa  228  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  68.71 
 
 		 162 aa  223  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  67.48 
 
 		 163 aa  220  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0286  putative nucleotide-binding protein  63.8 
 
 		 163 aa  217  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  64.2 
 
 		 164 aa  216  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  63.19 
 
 		 163 aa  214  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  61.35 
 
 		 164 aa  214  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  63.58 
 
 		 164 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  61.96 
 
 		 163 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  63.19 
 
 		 162 aa  211  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  62.8 
 
 		 165 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  61.82 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  64.85 
 
 		 167 aa  208  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  64.42 
 
 		 163 aa  208  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  62.35 
 
 		 163 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  59.51 
 
 		 163 aa  203  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0561  protein of unknown function DUF520  59.39 
 
 		 165 aa  203  7e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.637028  normal  0.064143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07620  hypothetical protein  60.62 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0480829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  59.51 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  56.44 
 
 		 163 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  60.74 
 
 		 162 aa  186  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  55.21 
 
 		 162 aa  184  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  56.44 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  55.21 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  57.83 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  50.91 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  48.77 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  48.78 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  49.08 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  48.75 
 
 		 163 aa  136  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4047  hypothetical protein  45.78 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  44.38 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  44.65 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  42.94 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  46.39 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  44.85 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  42.94 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  45.45 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  45.28 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  47.56 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  43.12 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  43.12 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2524  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 		 163 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0784  protein of unknown function DUF520  46.63 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00367732  normal  0.156821 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06941  putative nucleotide-binding protein  43.98 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  40.62 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  44.03 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0652  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  44.79 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  39.13 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  41.51 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1708  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>