More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0501 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0501  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
200 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.41 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  41.18 
 
 
196 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0521  Redoxin domain protein  40.45 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000754545  hitchhiker  0.00309639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  37.97 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0269  Redoxin domain-containing protein  42.07 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.890492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0926  Redoxin domain protein  41.03 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  40.91 
 
 
205 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  43.45 
 
 
200 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  40.12 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4433  redoxin domain-containing protein  41.24 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  35.87 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2734  Redoxin domain protein  42.68 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627049  normal  0.0544448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  40.69 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0444  Redoxin domain protein  40.78 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.567513  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  41.3 
 
 
203 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  41.3 
 
 
203 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  41.3 
 
 
203 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10537  thioredoxin  40.1 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.154005  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  40.64 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  37.58 
 
 
248 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  35.6 
 
 
213 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  48.39 
 
 
237 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  43.75 
 
 
194 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.58 
 
 
200 aa  101  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07200  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  37.8 
 
 
181 aa  101  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3254  Redoxin domain protein  40 
 
 
198 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0648017  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0689  Redoxin domain protein  40.97 
 
 
188 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24350  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  37.37 
 
 
203 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.97 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0827  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.52 
 
 
179 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3240  redoxin domain-containing protein  35.96 
 
 
198 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0705  redoxin domain-containing protein  36.84 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0692  redoxin  36.84 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0685  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.84 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0866  redoxin domain-containing protein  38.67 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141982  normal  0.0297264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4484  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.34 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0052  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.84 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  35.67 
 
 
188 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  39.35 
 
 
209 aa  94.7  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.18 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  37.57 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5347  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.82 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5664  redoxin domain-containing protein  33.82 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  36.89 
 
 
180 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.82 
 
 
240 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.22 
 
 
191 aa  88.6  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000658769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3710  redoxin domain-containing protein  32.51 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02940  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  35.75 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0986235  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.51 
 
 
240 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1036  Redoxin domain protein  34.64 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  23.12 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  29.66 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.22 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.51 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.17 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0341  redoxin domain-containing protein  34.78 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08080  Peroxiredoxin  34.48 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000479463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  34.96 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  31.5 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  38.94 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  34.03 
 
 
184 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  33.63 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  33.59 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  34.51 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2801  thiol-disulfide interchange protein  33.59 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00941693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.13 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  34.78 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.84 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  33.12 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  33.63 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  28 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  33.12 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  36.79 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.24 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.76 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  32.47 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  35.82 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  28.37 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.92 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  32.85 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  31.72 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  34.65 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  34.65 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  25.68 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.85 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.03 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  33.59 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0940  periplasmic protein thiol/disulfide oxidoreductase DsbE  29.13 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.33 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  24.14 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  24.14 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.71 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  34.68 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  33.06 
 
 
175 aa  67  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  35.09 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.95 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>