More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0477 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 203 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  47 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  43.94 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  45.88 
 
 		 215 aa  151  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 198 aa  151  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 217 aa  148  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 198 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 204 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 204 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  40.53 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  39.79 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  35.5 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 193 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 191 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  49.23 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  35.04 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  47.46 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6471  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  49.09 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  49.09 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  37.98 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  49.12 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>