More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0444 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  62.79 
 
 		 698 aa  760    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.76 
 
 		 669 aa  791    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.51 
 
 		 685 aa  818    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.63 
 
 		 794 aa  662    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.66 
 
 		 643 aa  646    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  52.62 
 
 		 769 aa  648    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.65 
 
 		 615 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.65 
 
 		 753 aa  761    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  66.72 
 
 		 682 aa  843    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.33 
 
 		 611 aa  658    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.48 
 
 		 672 aa  869    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.75 
 
 		 798 aa  733    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.33 
 
 		 669 aa  800    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.59 
 
 		 671 aa  777    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  56.19 
 
 		 760 aa  661    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.12 
 
 		 760 aa  716    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  66.78 
 
 		 753 aa  762    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.29 
 
 		 639 aa  647    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.52 
 
 		 801 aa  665    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.91 
 
 		 679 aa  804    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  64.41 
 
 		 684 aa  798    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.08 
 
 		 659 aa  823    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.63 
 
 		 671 aa  776    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.33 
 
 		 653 aa  654    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.53 
 
 		 743 aa  728    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.43 
 
 		 602 aa  648    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  56.44 
 
 		 783 aa  664    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.45 
 
 		 651 aa  635    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  56.74 
 
 		 627 aa  659    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.95 
 
 		 687 aa  793    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.97 
 
 		 704 aa  681    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  65.56 
 
 		 656 aa  832    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.41 
 
 		 696 aa  769    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.64 
 
 		 662 aa  773    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.3 
 
 		 677 aa  761    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.29 
 
 		 672 aa  824    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  62.38 
 
 		 689 aa  788    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.36 
 
 		 684 aa  769    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  66.56 
 
 		 654 aa  815    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  100 
 
 		 681 aa  1378    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  55.33 
 
 		 697 aa  669    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  56.44 
 
 		 783 aa  664    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  56.6 
 
 		 784 aa  665    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.42 
 
 		 781 aa  666    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.79 
 
 		 793 aa  672    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.94 
 
 		 682 aa  793    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.4 
 
 		 612 aa  628  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.73 
 
 		 612 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.43 
 
 		 599 aa  629  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  52.82 
 
 		 614 aa  627  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  52.37 
 
 		 608 aa  627  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.06 
 
 		 620 aa  625  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.59 
 
 		 657 aa  622  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.14 
 
 		 759 aa  618  1e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.21 
 
 		 647 aa  617  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.53 
 
 		 630 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.23 
 
 		 617 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  50 
 
 		 673 aa  613  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.22 
 
 		 639 aa  610  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.72 
 
 		 632 aa  611  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.37 
 
 		 750 aa  610  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  49.46 
 
 		 647 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  49.3 
 
 		 647 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  49.46 
 
 		 647 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  50.4 
 
 		 612 aa  611  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  49.46 
 
 		 647 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51 
 
 		 637 aa  609  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  49.3 
 
 		 647 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  50.74 
 
 		 644 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.32 
 
 		 647 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  50.74 
 
 		 644 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 		 655 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  50.74 
 
 		 644 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  50.32 
 
 		 647 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  50.9 
 
 		 631 aa  608  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  50.74 
 
 		 644 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  53.64 
 
 		 693 aa  605  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.07 
 
 		 610 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 		 657 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  50.32 
 
 		 647 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.07 
 
 		 610 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 		 621 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  50.32 
 
 		 647 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.52 
 
 		 635 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  50.16 
 
 		 647 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.69 
 
 		 651 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  50.58 
 
 		 644 aa  603  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.48 
 
 		 630 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.9 
 
 		 608 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  51.35 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  48.77 
 
 		 649 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.68 
 
 		 656 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  49.37 
 
 		 643 aa  604  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.22 
 
 		 635 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.82 
 
 		 662 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  50.56 
 
 		 633 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  50.56 
 
 		 633 aa  599  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  52.32 
 
 		 616 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 		 650 aa  601  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  50.72 
 
 		 633 aa  601  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>