More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0441 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 
321 aa  620  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8428  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  54.15 
 
 
358 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.8 
 
 
334 aa  259  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2897  helix-turn-helix, Fis-type  55.87 
 
 
324 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3449  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  56.43 
 
 
325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9177  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  52.58 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.55 
 
 
339 aa  230  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.35 
 
 
344 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  56.54 
 
 
335 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4313  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.07 
 
 
595 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35710  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.4 
 
 
324 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.6 
 
 
608 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0614  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.4 
 
 
341 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0149  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.29 
 
 
376 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0831  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.46 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4748  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.51 
 
 
333 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.26 
 
 
334 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.85 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0202  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  57.08 
 
 
398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.135787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.51 
 
 
351 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0555  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.98 
 
 
312 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5378  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.08 
 
 
323 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4020  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.22 
 
 
317 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1411  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.19 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0625  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.97 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.12 
 
 
364 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.66 
 
 
308 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955861  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24800  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.72 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0529  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  55.85 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1134  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.6 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13656  cell cycle protein mesJ  43.71 
 
 
323 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0912729  decreased coverage  0.0000749619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0700  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.07 
 
 
330 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5162  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.84 
 
 
320 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.540091  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.36 
 
 
388 aa  156  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4776  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  46.84 
 
 
320 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4862  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.84 
 
 
320 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2989  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.8 
 
 
384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1594  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.69 
 
 
457 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.48 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.82 
 
 
524 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3251  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.74 
 
 
344 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0128413  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.02 
 
 
455 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01210  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.48 
 
 
394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.91 
 
 
509 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.43 
 
 
470 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.36 
 
 
326 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.03 
 
 
336 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.86 
 
 
468 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.33 
 
 
472 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  29.43 
 
 
342 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1891  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  36.54 
 
 
468 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460009  hitchhiker  0.0000000000638883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30 
 
 
326 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.09 
 
 
471 aa  123  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.17 
 
 
456 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2997  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.6 
 
 
323 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.23 
 
 
462 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1179  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.57 
 
 
464 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34468  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1464  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.57 
 
 
464 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.727377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.16 
 
 
476 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  30.16 
 
 
476 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  30.16 
 
 
476 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  30.16 
 
 
476 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  30.16 
 
 
476 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.42 
 
 
472 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  29.84 
 
 
476 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.84 
 
 
476 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.36 
 
 
476 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.68 
 
 
459 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000920326  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0689  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.86 
 
 
409 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.64 
 
 
473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.66 
 
 
476 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.66 
 
 
476 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.51 
 
 
476 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.53 
 
 
481 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0964  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.51 
 
 
461 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.64 
 
 
345 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5309  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.72 
 
 
347 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4841  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.23 
 
 
342 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0339142  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00761  ATPase  35.29 
 
 
343 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1810  cell cycle protein MesJ, putative  39.13 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.7 
 
 
464 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.48 
 
 
476 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0074  MesJ-like protein  34.21 
 
 
337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2027  ketose-bisphosphate aldolase, class-II  32.19 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.481135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0580  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  38.06 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0306545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2248  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.22 
 
 
485 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000793902  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.47 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.21 
 
 
521 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  34.65 
 
 
458 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4744  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  40.09 
 
 
346 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0139  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.54 
 
 
492 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00237598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.88 
 
 
480 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0074  MesJ-like protein  35.74 
 
 
334 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5387  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.86 
 
 
342 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2711  tRNA(Ile)-lysidine synthase  38.02 
 
 
371 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.658001  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1138  hypothetical protein  36.47 
 
 
336 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.743192  normal  0.140512 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17771  ATPase  30.57 
 
 
339 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0884418  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  41.15 
 
 
345 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381977  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2960  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.43 
 
 
460 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0827717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>