186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0388 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  100 
 
 		 521 aa  1038    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  50.2 
 
 		 515 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  45.79 
 
 		 508 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  47.06 
 
 		 527 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  44.12 
 
 		 524 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  43.3 
 
 		 521 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  45.44 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  43.98 
 
 		 541 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  41.05 
 
 		 537 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  44.82 
 
 		 525 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  43.19 
 
 		 523 aa  372  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  44.77 
 
 		 507 aa  364  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  46.51 
 
 		 485 aa  363  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  43.83 
 
 		 515 aa  363  5.0000000000000005e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  43.6 
 
 		 542 aa  356  5.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  39.6 
 
 		 518 aa  347  4e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  42.76 
 
 		 495 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  39.22 
 
 		 522 aa  333  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  42.36 
 
 		 500 aa  329  8e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  38.3 
 
 		 545 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  36.83 
 
 		 546 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  38.49 
 
 		 518 aa  289  9e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  39.55 
 
 		 533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  39.55 
 
 		 508 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  39.55 
 
 		 508 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  37.14 
 
 		 511 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  37.14 
 
 		 511 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  37.14 
 
 		 511 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  38.6 
 
 		 525 aa  279  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  37.11 
 
 		 520 aa  277  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  37.76 
 
 		 522 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  36.89 
 
 		 540 aa  273  7e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  38.8 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  37.78 
 
 		 520 aa  270  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  36.22 
 
 		 542 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  38.83 
 
 		 505 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  37.42 
 
 		 538 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  37.5 
 
 		 521 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  38.66 
 
 		 505 aa  256  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  36.2 
 
 		 516 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  36.1 
 
 		 551 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  34.26 
 
 		 564 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  32.03 
 
 		 499 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  34.59 
 
 		 557 aa  210  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  35.2 
 
 		 535 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  29.19 
 
 		 544 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  30.69 
 
 		 504 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  32.06 
 
 		 643 aa  193  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  31.22 
 
 		 476 aa  189  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  30.87 
 
 		 504 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  34 
 
 		 535 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  29.75 
 
 		 486 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  31.82 
 
 		 505 aa  186  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  31.03 
 
 		 506 aa  186  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  32.01 
 
 		 530 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  32.09 
 
 		 551 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  33.83 
 
 		 571 aa  183  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  31.58 
 
 		 546 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  31.41 
 
 		 532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  29.85 
 
 		 522 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  30.83 
 
 		 518 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  31.48 
 
 		 539 aa  179  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  29.94 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  30.04 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  30.48 
 
 		 542 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  31.73 
 
 		 556 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  33.4 
 
 		 521 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  31.49 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  30.19 
 
 		 508 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  29.65 
 
 		 532 aa  170  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  31.1 
 
 		 504 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  43.5 
 
 		 300 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  29.05 
 
 		 499 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  31.98 
 
 		 547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  30.46 
 
 		 597 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  31.7 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  30.61 
 
 		 520 aa  159  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  29.13 
 
 		 527 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  29.07 
 
 		 505 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  29.62 
 
 		 505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  29.18 
 
 		 514 aa  153  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  31.21 
 
 		 493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  36.36 
 
 		 597 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  31.97 
 
 		 524 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  27.05 
 
 		 494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  29.39 
 
 		 536 aa  140  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  35.38 
 
 		 613 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1577  TAP domain protein  28.79 
 
 		 514 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  34.5 
 
 		 525 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 486 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  30.64 
 
 		 524 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  27.4 
 
 		 566 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  26.81 
 
 		 750 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  27.93 
 
 		 559 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  32.23 
 
 		 517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  33.2 
 
 		 542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  26.74 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  34.01 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  26.87 
 
 		 475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6096  TAP domain protein  29.85 
 
 		 557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>