More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0360 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  100 
 
 
275 aa  551  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  45.08 
 
 
239 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  45.08 
 
 
239 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  45.08 
 
 
239 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  45.19 
 
 
246 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  44.08 
 
 
242 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  44.17 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  42.56 
 
 
271 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 
263 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  44.07 
 
 
243 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 
259 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  38.82 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  40.08 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
259 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  41.18 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  41.45 
 
 
245 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
252 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  48.65 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  38.72 
 
 
247 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  36.44 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 
270 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  38.84 
 
 
255 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  38.14 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  46.05 
 
 
260 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  45.45 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.3 
 
 
308 aa  108  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.4 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  31.54 
 
 
251 aa  89  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  31.54 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  42.19 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  31.54 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  33.13 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  31.54 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  31.54 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  31.54 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  32.08 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  38.67 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  40.44 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  43.2 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  48.62 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  39.71 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  43.65 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  30.41 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
255 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
255 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  44.19 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  32 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  29.2 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  29.15 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  40 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  40.31 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  43.3 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  40.3 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  38.64 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  29.08 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  29.08 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  39.53 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  39.2 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0671  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.58 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  36.51 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  39.39 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  36.43 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 
495 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  30.98 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  40.8 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.42 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3569  methyltransferase type 11  35.65 
 
 
208 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  38.64 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  38.52 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38.52 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  34.22 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  40.57 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  30.15 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  37.6 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  36.28 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  37.1 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.08 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  36.28 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  44.79 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  33.33 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  29.55 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  31.78 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  36 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>