More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0347 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  70.31 
 
 
557 aa  661    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  69.27 
 
 
537 aa  642    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  70.56 
 
 
536 aa  667    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 
534 aa  1035    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  70.86 
 
 
557 aa  668    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  66.85 
 
 
568 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  68.22 
 
 
536 aa  631  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3815  Na+/solute symporter  65.28 
 
 
584 aa  605  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  65.28 
 
 
551 aa  597  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  60.44 
 
 
561 aa  578  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3373  SSS sodium solute transporter superfamily  62.32 
 
 
536 aa  570  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346982  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2862  Na+/solute symporter  62.55 
 
 
537 aa  567  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  63.43 
 
 
528 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  61.7 
 
 
532 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4284  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  61.55 
 
 
541 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231008  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4055  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  61.17 
 
 
541 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.647451  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4130  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  61.17 
 
 
541 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06910  SSS sodium solute transporter  60.84 
 
 
540 aa  562  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0219  SSS sodium solute transporter superfamily  61.6 
 
 
552 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1075  SSS sodium solute transporter superfamily  63.57 
 
 
546 aa  556  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.099805  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2139  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.98 
 
 
543 aa  555  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3659  SSS sodium solute transporter superfamily  62 
 
 
542 aa  551  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.641913  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  59.92 
 
 
528 aa  553  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  61.17 
 
 
543 aa  554  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252386  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1378  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  61.23 
 
 
538 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  61.38 
 
 
552 aa  544  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13340  SSS sodium solute transporter  60.11 
 
 
556 aa  539  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0683463  normal  0.0921974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1396  SSS sodium solute transporter superfamily  62.38 
 
 
538 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000408051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  59.81 
 
 
543 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1814  SSS sodium solute transporter superfamily  57.81 
 
 
545 aa  528  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5174  SSS sodium solute transporter superfamily  56.33 
 
 
525 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  54.84 
 
 
530 aa  519  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.27 
 
 
516 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  53.12 
 
 
516 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  53.12 
 
 
516 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  53.12 
 
 
516 aa  508  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  53.12 
 
 
516 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  53.12 
 
 
516 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  52.93 
 
 
516 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  52.74 
 
 
516 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  52.93 
 
 
516 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  52.93 
 
 
516 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.93 
 
 
516 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  52.41 
 
 
513 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  53.55 
 
 
511 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  50.37 
 
 
519 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  50.57 
 
 
515 aa  473  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2994  Na+/solute symporter  55.05 
 
 
632 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.77047  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.43 
 
 
515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.81 
 
 
659 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  44.93 
 
 
584 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  47.47 
 
 
551 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  47.47 
 
 
551 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  44.52 
 
 
665 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  48.13 
 
 
552 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  44.52 
 
 
661 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  47.47 
 
 
554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  47.47 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.02 
 
 
539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  47.65 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  47.37 
 
 
554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  48.61 
 
 
559 aa  445  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  43.75 
 
 
584 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  46.63 
 
 
552 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  46.63 
 
 
552 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  44.26 
 
 
584 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  45.06 
 
 
665 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  45.39 
 
 
664 aa  438  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  46.87 
 
 
553 aa  433  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  46.83 
 
 
550 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  47.23 
 
 
541 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  46.77 
 
 
576 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.85 
 
 
541 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  46.77 
 
 
576 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  47.04 
 
 
541 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  44.59 
 
 
584 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  45.59 
 
 
552 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  46.87 
 
 
576 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  45.03 
 
 
552 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  46.67 
 
 
563 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  46.34 
 
 
551 aa  425  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  46.53 
 
 
551 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  46.53 
 
 
551 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  45.59 
 
 
552 aa  425  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  46.15 
 
 
549 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  45.97 
 
 
549 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  46.15 
 
 
549 aa  425  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  47.01 
 
 
513 aa  425  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0375  acetate permease  47.76 
 
 
553 aa  425  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  46.15 
 
 
549 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  45.59 
 
 
552 aa  425  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  46.15 
 
 
549 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  46.15 
 
 
549 aa  425  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  45.78 
 
 
549 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  46.15 
 
 
549 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  46.15 
 
 
549 aa  425  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  45.19 
 
 
554 aa  419  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5783  acetate permease  47.57 
 
 
553 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  45.78 
 
 
549 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  45.59 
 
 
549 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>