More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0341 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0341  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
203 aa  400  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1992  twin-arginine translocation pathway signal  42.38 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4318  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.91 
 
 
204 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.077918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  40.84 
 
 
203 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4758  redoxin domain-containing protein  37.08 
 
 
204 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366616  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0508  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.88 
 
 
206 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.787704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0520  Redoxin domain protein  40.4 
 
 
196 aa  95.5  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.23 
 
 
187 aa  95.5  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5202  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.8 
 
 
215 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000747567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4815  redoxin  35.8 
 
 
215 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.502613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4901  redoxin domain-containing protein  35.8 
 
 
215 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  37.84 
 
 
192 aa  85.5  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.75 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  37.3 
 
 
168 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3929  Redoxin domain protein  34.95 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  27.46 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  27.46 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  27.46 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  27.46 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  27.46 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.95 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  42.99 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  35.65 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  36.43 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5432  redoxin domain-containing protein  34.48 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97982  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  27.46 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  36.75 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1374  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.98 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.251061  normal  0.0564426 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.77 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  26.76 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0940  periplasmic protein thiol/disulfide oxidoreductase DsbE  32.62 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.06 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  32.54 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13704  membrane-anchored thioredoxin-like protein  33.33 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0501  redoxin domain-containing protein  34.78 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  29.71 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.94 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1405  putative thioredoxin related protein  36.3 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  30.07 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  36.72 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5883  Redoxin domain protein  39.29 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  38.1 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  32.64 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.47 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  29.66 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.97 
 
 
280 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  25.85 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  35.77 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  33.33 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  36.22 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  25.35 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.23 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.9 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.95 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1491  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.91 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.327411 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  31.2 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  35.54 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0256  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.46 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.53 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0478  redoxin domain-containing protein  26.95 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.38 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.08 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  30.5 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0984  thioredoxin  38.79 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  34.55 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1710  Redoxin domain protein  35.16 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  29.29 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3552  redoxin domain-containing protein  26.24 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  33.08 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.21 
 
 
455 aa  66.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.14 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0476  redoxin domain-containing protein  26.24 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  34.02 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  30.86 
 
 
447 aa  66.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.81 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0866  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.93 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  30 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  30.4 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4227  thioredoxin, putative  33.01 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0895869  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  30.4 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  25.38 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  33.87 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  30.4 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  30.4 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0836  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.6 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  unclonable  0.000000000312074 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  40.51 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  34.59 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  30.46 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  35.04 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  31.43 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4009  redoxin domain-containing protein  27.78 
 
 
332 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  32.39 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0446  redoxin domain-containing protein  28.28 
 
 
316 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.75 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3887  redoxin domain-containing protein  27.78 
 
 
316 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3813  Redoxin domain protein  27.08 
 
 
305 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  36.29 
 
 
433 aa  64.7  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.75 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>