More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0326 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 807 aa  1651    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  41.53 
 
 		 801 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  41.17 
 
 		 773 aa  528  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  42.29 
 
 		 739 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  40.83 
 
 		 820 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  41.88 
 
 		 744 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  37.94 
 
 		 789 aa  479  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  39.24 
 
 		 740 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  41.37 
 
 		 880 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  41 
 
 		 1057 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.64 
 
 		 737 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  40.38 
 
 		 892 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.88 
 
 		 736 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.98 
 
 		 759 aa  442  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.97 
 
 		 747 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 		 871 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 		 819 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  37.43 
 
 		 784 aa  405  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  35.48 
 
 		 833 aa  398  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.12 
 
 		 821 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  36.39 
 
 		 821 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 		 877 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  39.32 
 
 		 758 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  37.04 
 
 		 814 aa  382  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 		 808 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 		 801 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  36.59 
 
 		 807 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.16 
 
 		 817 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.23 
 
 		 763 aa  376  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.03 
 
 		 705 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 		 766 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  39.12 
 
 		 758 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  38.53 
 
 		 726 aa  365  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  35.17 
 
 		 838 aa  362  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  34.64 
 
 		 727 aa  360  4e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  35.73 
 
 		 723 aa  356  7.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.46 
 
 		 766 aa  356  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  35.97 
 
 		 721 aa  351  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.25 
 
 		 695 aa  347  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  34.3 
 
 		 772 aa  346  8e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  35.22 
 
 		 771 aa  345  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  35.46 
 
 		 765 aa  340  4e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  35.34 
 
 		 773 aa  340  5e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 		 710 aa  334  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 		 710 aa  334  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  37.48 
 
 		 680 aa  324  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  32.87 
 
 		 830 aa  319  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 		 816 aa  316  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 		 816 aa  316  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 816 aa  315  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.31 
 
 		 727 aa  313  6.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.31 
 
 		 720 aa  309  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.37 
 
 		 816 aa  303  7.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  32.61 
 
 		 810 aa  300  6e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 		 648 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 830 aa  299  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.4 
 
 		 761 aa  297  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 		 818 aa  297  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  31.99 
 
 		 768 aa  297  7e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 831 aa  296  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 831 aa  296  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  36.98 
 
 		 703 aa  294  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 		 817 aa  293  9e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 		 840 aa  291  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 		 824 aa  291  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 		 828 aa  291  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.51 
 
 		 761 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  32.91 
 
 		 693 aa  283  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  32.73 
 
 		 723 aa  283  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  36.06 
 
 		 722 aa  280  9e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  30.75 
 
 		 649 aa  279  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  35.91 
 
 		 700 aa  278  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  32.03 
 
 		 661 aa  273  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.8 
 
 		 727 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  31.02 
 
 		 750 aa  268  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.88 
 
 		 710 aa  266  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.32 
 
 		 806 aa  263  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  29.63 
 
 		 705 aa  261  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.87 
 
 		 643 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  30.17 
 
 		 618 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  30.33 
 
 		 640 aa  245  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  32.54 
 
 		 761 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  31.09 
 
 		 643 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  31.69 
 
 		 710 aa  244  5e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  31.09 
 
 		 643 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  32.64 
 
 		 712 aa  243  7e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  30.19 
 
 		 654 aa  240  9e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  29.2 
 
 		 824 aa  240  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  29.04 
 
 		 824 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  32.08 
 
 		 681 aa  238  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  32.1 
 
 		 626 aa  237  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  31.24 
 
 		 726 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  30.5 
 
 		 811 aa  235  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  30.87 
 
 		 776 aa  235  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  30.76 
 
 		 795 aa  233  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  28.55 
 
 		 750 aa  232  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 742 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  31 
 
 		 677 aa  232  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  29.19 
 
 		 658 aa  232  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  29.97 
 
 		 667 aa  231  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>