More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0274 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  100 
 
 		 247 aa  498  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  59.48 
 
 		 250 aa  268  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  55.13 
 
 		 277 aa  248  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  56 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  57.49 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  54.84 
 
 		 271 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  54.27 
 
 		 290 aa  221  8e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  60 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  49.79 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  55 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  51.5 
 
 		 204 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  40.93 
 
 		 313 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  40.67 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  40.67 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  40.67 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  40.67 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  40.67 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  40.67 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  40.67 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  40.67 
 
 		 216 aa  188  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  43.08 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  40.19 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  47.26 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  41.15 
 
 		 216 aa  185  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  41.98 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  41.21 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  39.7 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  44.27 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  43.55 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  43.55 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  44.27 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  41.71 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  42.77 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  36.06 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  44.44 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  31.19 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  31.19 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  39 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  36.41 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  36.41 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  36.04 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  36.6 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  37.63 
 
 		 212 aa  141  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  37.63 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  37.11 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  37.11 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  37.11 
 
 		 212 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  37.11 
 
 		 212 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  37.11 
 
 		 212 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  37.11 
 
 		 212 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  37.11 
 
 		 215 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  37.11 
 
 		 212 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  37.11 
 
 		 212 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  37.11 
 
 		 212 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  36.36 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  36.92 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  36.32 
 
 		 191 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  36.96 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  39.64 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  35.33 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  34.17 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  28.93 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0652  RelA/SpoT family protein  30.51 
 
 		 750 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0645  GTP pyrophosphokinase (ATP:GTP 3'-pyrophosphotransferase)(ppGpp synthetase I) ((P)ppGpp synthetase)  30.51 
 
 		 750 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  31.46 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.96 
 
 		 705 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  30.96 
 
 		 705 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  30.23 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.46 
 
 		 705 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1894  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.76 
 
 		 753 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818102  hitchhiker  0.00061937 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  35.79 
 
 		 388 aa  65.5  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2255  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  33.68 
 
 		 769 aa  65.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.3559  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1922  RelA/SpoT protein  34.86 
 
 		 774 aa  65.1  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.604164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  32.89 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1800  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.04 
 
 		 723 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4687  GTP pyrophosphokinase  33.55 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  38.94 
 
 		 736 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3877  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.7 
 
 		 742 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2647  RelA/SpoT family protein  35.66 
 
 		 762 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0342541  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1874  GTP diphosphokinase  34.04 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.730931  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  32.89 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02364  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase ((ppGpp)ase)  33.57 
 
 		 712 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12840  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  31.79 
 
 		 759 aa  63.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00420725  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2608  (p)ppGpp synthetase I  34.97 
 
 		 761 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0347856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2968  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.66 
 
 		 760 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0946  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.74 
 
 		 745 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  30.68 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2636  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.01 
 
 		 748 aa  63.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  31.85 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2856  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.56 
 
 		 749 aa  62  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0013983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1575  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.5 
 
 		 743 aa  62  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2518  GTP pyrophosphokinase  27.75 
 
 		 745 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.326663  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.58 
 
 		 717 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144176  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2868  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.09 
 
 		 719 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.706713  normal  0.0333863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3149  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.78 
 
 		 747 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002504  GTP pyrophosphokinase (p)ppGpp synthetase I  28.87 
 
 		 739 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000545051  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4366  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.03 
 
 		 736 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.172141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2445  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.36 
 
 		 737 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1735  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.05 
 
 		 747 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0033  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.33 
 
 		 737 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0805282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>