More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0177 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  100 
 
 
264 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  48.15 
 
 
269 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  47.71 
 
 
285 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  48.87 
 
 
268 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  48.3 
 
 
265 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.32 
 
 
265 aa  198  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  50.38 
 
 
264 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.53 
 
 
265 aa  186  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  44.12 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  48.33 
 
 
281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  45.08 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  43.4 
 
 
278 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  42.53 
 
 
272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  40.54 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.92 
 
 
290 aa  161  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  41.22 
 
 
267 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  41.67 
 
 
267 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  37.64 
 
 
270 aa  155  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  41.11 
 
 
282 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  38.35 
 
 
271 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  38.35 
 
 
271 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  38.72 
 
 
271 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  38.89 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  43.01 
 
 
303 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.62 
 
 
272 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  37.45 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  37.64 
 
 
277 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  37.55 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.01 
 
 
308 aa  128  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  37.93 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  39.54 
 
 
259 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  36.03 
 
 
277 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  36.54 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  35.48 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  40.61 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.87 
 
 
288 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.324919  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.61 
 
 
265 aa  105  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  34.87 
 
 
284 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  28.22 
 
 
269 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  27.87 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.87 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  27.87 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  27.87 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  27.87 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.87 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  27.87 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.53 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  28.1 
 
 
273 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1895  HAD superfamily hydrolase  30.45 
 
 
278 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  30.96 
 
 
270 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.74 
 
 
266 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.32 
 
 
269 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.53 
 
 
269 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  27.76 
 
 
269 aa  99  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  30 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  29.03 
 
 
268 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  34.07 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  30.15 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  32.6 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.57 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.7 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.09 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.64 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  28.3 
 
 
273 aa  92.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  30.15 
 
 
266 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  27.86 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0900  Cof-like hydrolase  30.43 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.183998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  33.08 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  29.67 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  30.11 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  26.04 
 
 
257 aa  89  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  25.64 
 
 
274 aa  89  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  28.41 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  28.36 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  27.9 
 
 
262 aa  86.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.79 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  30.07 
 
 
285 aa  86.3  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.78 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  32.69 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  30.63 
 
 
279 aa  85.5  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  33.57 
 
 
282 aa  85.5  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  29.3 
 
 
279 aa  85.5  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  31.06 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  29.35 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  29.35 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.24 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  28.67 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  26.42 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  29.35 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  29.35 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  24.54 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  26.42 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  26.91 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  29.35 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  25.54 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  29.59 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  29.35 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  24.54 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>