More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0138 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  100 
 
 
903 aa  1773    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  48.73 
 
 
1029 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  46.53 
 
 
1019 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.51 
 
 
925 aa  479  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  44.76 
 
 
924 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  42.76 
 
 
1013 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  45.12 
 
 
1074 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  39.36 
 
 
918 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
918 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  39.36 
 
 
918 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  39.36 
 
 
918 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  39.2 
 
 
918 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  39.36 
 
 
918 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  39.08 
 
 
918 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  39.3 
 
 
918 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  39.18 
 
 
918 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  39.2 
 
 
918 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  44.67 
 
 
1050 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.17 
 
 
1028 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  38.96 
 
 
918 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  44.15 
 
 
958 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  45.41 
 
 
990 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  38.03 
 
 
1078 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  40.32 
 
 
1185 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  37.45 
 
 
1175 aa  458  1e-127  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.13 
 
 
933 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.39 
 
 
1048 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  41.94 
 
 
1072 aa  453  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.17 
 
 
1112 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  37.11 
 
 
1006 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
1007 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  44.01 
 
 
1040 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  41.04 
 
 
980 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  42.18 
 
 
988 aa  435  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.54 
 
 
1047 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  40.47 
 
 
1047 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  43.23 
 
 
1033 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  35.12 
 
 
1152 aa  427  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  37.22 
 
 
1007 aa  426  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  43.02 
 
 
949 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  49.59 
 
 
621 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  39.6 
 
 
1048 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  36.34 
 
 
1194 aa  410  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  39.33 
 
 
1065 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  36.72 
 
 
886 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  35.59 
 
 
1067 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  42.27 
 
 
898 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  39.71 
 
 
1063 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  42.65 
 
 
901 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  43.2 
 
 
899 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.88 
 
 
1026 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  35.98 
 
 
1019 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  40.92 
 
 
892 aa  392  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  39.7 
 
 
1099 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.71 
 
 
895 aa  387  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  40.16 
 
 
902 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  41.51 
 
 
917 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 
1082 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  35.57 
 
 
1125 aa  379  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.17 
 
 
1112 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  40.51 
 
 
1531 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  45.19 
 
 
617 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  39.09 
 
 
1087 aa  369  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  42.45 
 
 
1086 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  40.16 
 
 
1077 aa  369  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  42.44 
 
 
1354 aa  361  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  42.33 
 
 
931 aa  361  4e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.67 
 
 
1104 aa  361  4e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  40.34 
 
 
1068 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  40.15 
 
 
1130 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  39.05 
 
 
1031 aa  353  5e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  44.2 
 
 
1120 aa  352  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  41.67 
 
 
1088 aa  350  5e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  35 
 
 
1068 aa  349  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  41.46 
 
 
1088 aa  347  4e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  43.82 
 
 
777 aa  347  5e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  41.53 
 
 
1073 aa  347  7e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.26 
 
 
1139 aa  346  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  42.57 
 
 
1091 aa  345  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 
1069 aa  345  2e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.38 
 
 
1129 aa  344  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  41.03 
 
 
1088 aa  344  4e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  41.11 
 
 
991 aa  344  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  40.29 
 
 
1284 aa  343  7e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  40.79 
 
 
1084 aa  343  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  39.92 
 
 
1437 aa  342  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.33 
 
 
1091 aa  341  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  40.09 
 
 
1386 aa  341  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.34 
 
 
1082 aa  341  5e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  37.96 
 
 
1134 aa  339  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  38.52 
 
 
977 aa  340  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  44.8 
 
 
663 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  40.46 
 
 
1127 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  40.77 
 
 
1070 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  40.22 
 
 
1362 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  43.01 
 
 
1357 aa  338  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.28 
 
 
982 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.46 
 
 
1073 aa  337  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  44.59 
 
 
773 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  39.23 
 
 
959 aa  337  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>