More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0133 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.94 
 
 		 708 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61 
 
 		 979 aa  796    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.47 
 
 		 689 aa  771    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.5 
 
 		 691 aa  769    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  60.85 
 
 		 766 aa  791    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.58 
 
 		 704 aa  762    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  53.95 
 
 		 788 aa  691    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  61.05 
 
 		 733 aa  746    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  62.08 
 
 		 691 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.17 
 
 		 712 aa  727    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  61.06 
 
 		 706 aa  760    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  60.19 
 
 		 723 aa  756    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.62 
 
 		 756 aa  726    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  58.6 
 
 		 691 aa  701    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.34 
 
 		 713 aa  677    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.69 
 
 		 754 aa  713    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.05 
 
 		 749 aa  699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.96 
 
 		 745 aa  655    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  66.15 
 
 		 724 aa  861    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.36 
 
 		 691 aa  767    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.26 
 
 		 734 aa  672    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.82 
 
 		 729 aa  679    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  60.36 
 
 		 718 aa  748    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 714 aa  1409    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.94 
 
 		 712 aa  696    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.36 
 
 		 691 aa  767    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  53.38 
 
 		 741 aa  599  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.6 
 
 		 762 aa  596  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.9 
 
 		 756 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.96 
 
 		 693 aa  507  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.6 
 
 		 708 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.93 
 
 		 698 aa  498  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.7 
 
 		 706 aa  497  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.57 
 
 		 697 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.19 
 
 		 679 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.24 
 
 		 706 aa  478  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.74 
 
 		 698 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.81 
 
 		 698 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.6 
 
 		 695 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.28 
 
 		 699 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.08 
 
 		 698 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.97 
 
 		 697 aa  442  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.54 
 
 		 693 aa  428  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.25 
 
 		 691 aa  424  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.66 
 
 		 691 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.23 
 
 		 448 aa  236  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.41 
 
 		 1376 aa  221  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.85 
 
 		 545 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.33 
 
 		 588 aa  212  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.4 
 
 		 543 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.4 
 
 		 543 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.4 
 
 		 543 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.85 
 
 		 602 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.29 
 
 		 562 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.35 
 
 		 590 aa  198  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.33 
 
 		 563 aa  195  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.3 
 
 		 607 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.53 
 
 		 552 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.22 
 
 		 626 aa  192  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.69 
 
 		 557 aa  190  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  39.74 
 
 		 621 aa  190  7e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.76 
 
 		 618 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.53 
 
 		 593 aa  189  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.53 
 
 		 593 aa  189  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.7 
 
 		 646 aa  188  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.21 
 
 		 593 aa  187  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.699983  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.41 
 
 		 600 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.39 
 
 		 633 aa  187  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.06 
 
 		 615 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.54 
 
 		 622 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.41 
 
 		 546 aa  184  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.22 
 
 		 621 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  37.54 
 
 		 637 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.42 
 
 		 630 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.71 
 
 		 592 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.45 
 
 		 592 aa  181  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  34.95 
 
 		 698 aa  181  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.42 
 
 		 636 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.39 
 
 		 637 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  38.79 
 
 		 618 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.57 
 
 		 612 aa  179  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  34.46 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.33 
 
 		 606 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.74 
 
 		 707 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43 
 
 		 588 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.49 
 
 		 606 aa  178  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.13 
 
 		 611 aa  177  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.13 
 
 		 611 aa  177  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.77 
 
 		 599 aa  178  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.17 
 
 		 451 aa  178  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1535  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.99 
 
 		 596 aa  177  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297932  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.16 
 
 		 615 aa  177  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  34.72 
 
 		 613 aa  177  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  29.8 
 
 		 690 aa  177  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  32.52 
 
 		 504 aa  177  9e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.05 
 
 		 793 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.2 
 
 		 602 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.13 
 
 		 611 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.19 
 
 		 607 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.48 
 
 		 590 aa  176  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>