216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0102 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  100 
 
 
337 aa  665    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  50.74 
 
 
345 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  45.71 
 
 
345 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  45.87 
 
 
359 aa  232  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  38.87 
 
 
311 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  33.98 
 
 
348 aa  189  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  34.8 
 
 
312 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  35.57 
 
 
315 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  38.46 
 
 
333 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  40.23 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  36.75 
 
 
311 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  35.59 
 
 
328 aa  162  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  28.34 
 
 
317 aa  155  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  31.83 
 
 
313 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  34.24 
 
 
344 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0326  peptidase M19 renal dipeptidase  33.21 
 
 
323 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  32.58 
 
 
307 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  29.39 
 
 
311 aa  135  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  30.8 
 
 
315 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  27.63 
 
 
297 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  36.1 
 
 
307 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  32.63 
 
 
342 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  31.32 
 
 
307 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17280  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  36.12 
 
 
400 aa  129  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.922551  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  31.32 
 
 
307 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  31.32 
 
 
307 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  30.07 
 
 
438 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  29.26 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  29.81 
 
 
307 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  36.07 
 
 
327 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  34.68 
 
 
353 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  27.34 
 
 
323 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  30.57 
 
 
307 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  37.79 
 
 
307 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  32.71 
 
 
307 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  30.19 
 
 
307 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  31.92 
 
 
412 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  31.6 
 
 
342 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  28.67 
 
 
381 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  29.78 
 
 
307 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  27.23 
 
 
323 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  26.81 
 
 
323 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  35.57 
 
 
349 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  32.84 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  31.75 
 
 
307 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  30.2 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  32.45 
 
 
323 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  30.51 
 
 
355 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  31.21 
 
 
352 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  33.33 
 
 
325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  30 
 
 
439 aa  119  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  26.26 
 
 
323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  26.26 
 
 
323 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  31.8 
 
 
315 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  28.63 
 
 
320 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  26.26 
 
 
323 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  29.93 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  26.26 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  26.26 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  30.93 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  32.64 
 
 
390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  27.49 
 
 
420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  36.79 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  29.27 
 
 
444 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  30.85 
 
 
412 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  28.22 
 
 
320 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  38.66 
 
 
349 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  38.66 
 
 
349 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  41.07 
 
 
344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  34.87 
 
 
394 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  27.16 
 
 
323 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  35.42 
 
 
350 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  27.04 
 
 
323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  29.51 
 
 
355 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  30.9 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  30.9 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  29.66 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  28.87 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  28.87 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  29.18 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  27.19 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  30.9 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  30.9 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  35.75 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  25.53 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  28.87 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  28.87 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  28.87 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  28.87 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  28.87 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  30.9 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  30.84 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  32.94 
 
 
338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  30.9 
 
 
320 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  30.34 
 
 
325 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  30.34 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  32.02 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  33.8 
 
 
342 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  25.8 
 
 
429 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  29.83 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>