More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0100 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0100  ABC transporter related  100 
 
 
527 aa  1025  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145472  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1811  ABC transporter related  39.17 
 
 
516 aa  326  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00289263  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  36.78 
 
 
506 aa  314  2e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3343  ABC transporter related  40.04 
 
 
505 aa  308  2e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  35.71 
 
 
506 aa  307  4e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 
516 aa  306  5e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 
507 aa  305  1e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  35.57 
 
 
507 aa  304  3e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  39.05 
 
 
507 aa  303  5e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  35.38 
 
 
507 aa  303  6e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0763  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 
505 aa  301  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.831413  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  35.39 
 
 
506 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  40 
 
 
508 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1593  ABC transporter related  41.14 
 
 
504 aa  297  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98451  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
510 aa  297  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3885  ABC transporter related protein  36.94 
 
 
509 aa  297  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3688  ABC transporter related  37.11 
 
 
509 aa  296  7e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  36.9 
 
 
505 aa  295  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3929  ABC transporter-related protein  36.54 
 
 
517 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.992166  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  34.42 
 
 
494 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  38.29 
 
 
504 aa  293  6e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  36.69 
 
 
504 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2713  ABC transporter related  35.97 
 
 
510 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1027  ABC transporter related  36.27 
 
 
502 aa  289  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8293  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  32.34 
 
 
496 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 
517 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 
517 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2366  ABC sugar (ribose) transporter, fused ATPase subunits  36.27 
 
 
502 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 
517 aa  289  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 
517 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  37.07 
 
 
529 aa  288  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  34.08 
 
 
495 aa  288  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  34.86 
 
 
510 aa  288  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3644  ABC transporter related  37.6 
 
 
508 aa  287  3e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  34.04 
 
 
513 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 
506 aa  286  6e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  33.2 
 
 
499 aa  286  6e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 
499 aa  286  7e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  9.63677e-06 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  35.27 
 
 
513 aa  286  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  36.95 
 
 
524 aa  285  1e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  35.96 
 
 
507 aa  285  1e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  36.93 
 
 
524 aa  285  1e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 
499 aa  285  1e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  36.95 
 
 
524 aa  285  1e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2343  ABC transporter related protein  38.01 
 
 
518 aa  284  2e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288241  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  37.4 
 
 
519 aa  284  2e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  32.52 
 
 
492 aa  284  2e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  35.76 
 
 
512 aa  284  2e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0611  ABC transporter related  37.67 
 
 
534 aa  284  3e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  34.12 
 
 
523 aa  284  3e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  33.4 
 
 
503 aa  284  3e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.10391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 
523 aa  284  3e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 
523 aa  284  3e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  38.6 
 
 
507 aa  283  4e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.55 
 
 
527 aa  283  5e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  37.48 
 
 
499 aa  283  5e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 
523 aa  283  6e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 
506 aa  283  6e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  35.25 
 
 
504 aa  283  7e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  33.46 
 
 
513 aa  283  8e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  32.18 
 
 
499 aa  282  9e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  36.19 
 
 
537 aa  282  9e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  32.18 
 
 
499 aa  282  9e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  37.52 
 
 
512 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  36.24 
 
 
510 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  36.21 
 
 
506 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  35.96 
 
 
507 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 
507 aa  280  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43610  ABC transporter  39.53 
 
 
516 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00213135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  40.12 
 
 
505 aa  280  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  33.8 
 
 
512 aa  280  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0076  ABC transporter related  41.84 
 
 
507 aa  279  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  36.93 
 
 
506 aa  280  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  36.63 
 
 
528 aa  279  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  35.67 
 
 
518 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  31.62 
 
 
495 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6411  ABC transporter related  36.65 
 
 
498 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  5.54602e-07  normal  0.729468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  35.93 
 
 
524 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  35.33 
 
 
524 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  34.18 
 
 
500 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.45 
 
 
492 aa  278  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  35.89 
 
 
518 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  36.77 
 
 
517 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  33.53 
 
 
511 aa  278  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  5.48441e-07 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  34 
 
 
497 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  36.96 
 
 
517 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  37.98 
 
 
522 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  36.68 
 
 
515 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  36.75 
 
 
517 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  36.77 
 
 
517 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  37.77 
 
 
519 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  36.77 
 
 
517 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4514  ABC transporter related  36.45 
 
 
498 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0372056  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5042  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  37.01 
 
 
498 aa  277  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.650295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 
500 aa  277  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  34.05 
 
 
517 aa  276  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  36.13 
 
 
524 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.58 
 
 
517 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  34.52 
 
 
516 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  31.26 
 
 
501 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>