55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0098 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  685  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  45 
 
 
354 aa  253  4e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  32.22 
 
 
371 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  30.64 
 
 
367 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  32.08 
 
 
367 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  32.77 
 
 
366 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  35.15 
 
 
362 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  35.96 
 
 
367 aa  142  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  32.23 
 
 
362 aa  142  1e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  28.73 
 
 
366 aa  141  1e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  33.9 
 
 
361 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  39.37 
 
 
344 aa  134  2e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  30.79 
 
 
366 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  31.7 
 
 
369 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  32.46 
 
 
367 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  35.37 
 
 
362 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  32.77 
 
 
367 aa  130  4e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  34.52 
 
 
355 aa  125  8e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  31.25 
 
 
360 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  34.45 
 
 
368 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  29.73 
 
 
365 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  30.92 
 
 
381 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  32.11 
 
 
375 aa  121  2e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  30.4 
 
 
372 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  26.74 
 
 
360 aa  118  2e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  28.49 
 
 
369 aa  116  7e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  32.99 
 
 
390 aa  115  8e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  33.33 
 
 
356 aa  115  2e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  28.52 
 
 
360 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  26.74 
 
 
369 aa  112  8e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  27.64 
 
 
374 aa  112  1e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  30.67 
 
 
374 aa  111  2e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  30.75 
 
 
357 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  31.03 
 
 
325 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  28.28 
 
 
369 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  25.7 
 
 
348 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  30.95 
 
 
362 aa  99.4  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  27.78 
 
 
369 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  30.82 
 
 
344 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  31.16 
 
 
370 aa  91.3  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  26.43 
 
 
983 aa  91.3  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  23.57 
 
 
371 aa  83.6  4e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  32.03 
 
 
994 aa  81.6  2e-14  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  28.02 
 
 
372 aa  80.9  3e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  25.85 
 
 
354 aa  78.6  2e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  31.54 
 
 
355 aa  76.3  9e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  27.23 
 
 
999 aa  73.2  6e-12  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  28.52 
 
 
373 aa  72.8  9e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  33.47 
 
 
381 aa  64.7  2e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  27.24 
 
 
363 aa  55.8  1e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  32.62 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  34.56 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3516  hypothetical protein  28.05 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  29.35 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  22.63 
 
 
427 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0278483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>