More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0095 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  70.1 
 
 
515 aa  711  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 
517 aa  1028  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  73.64 
 
 
519 aa  764  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  63.9 
 
 
507 aa  621  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  60.27 
 
 
522 aa  563  1e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  54.58 
 
 
517 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  55.34 
 
 
518 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  54.97 
 
 
519 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  51.66 
 
 
515 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  50.97 
 
 
519 aa  516  1e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  49.22 
 
 
518 aa  510  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  49.81 
 
 
516 aa  511  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  51.44 
 
 
526 aa  498  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  53.11 
 
 
517 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  44.32 
 
 
538 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  49.9 
 
 
516 aa  446  1e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  43.55 
 
 
523 aa  433  1e-120  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  45.07 
 
 
522 aa  417  1e-115  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  44.98 
 
 
522 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  46.6 
 
 
519 aa  407  1e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  49.81 
 
 
519 aa  405  1e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  49.12 
 
 
517 aa  400  1e-110  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  40.62 
 
 
513 aa  390  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  47.76 
 
 
521 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  41.01 
 
 
999 aa  362  1e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  38.75 
 
 
983 aa  350  3e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  37.27 
 
 
994 aa  312  9e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  33.2 
 
 
463 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3368  hydantoinase  35.33 
 
 
464 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00437315  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2206  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  35.37 
 
 
436 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00953084  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  29.34 
 
 
570 aa  154  3e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  31.68 
 
 
560 aa  153  6e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  31.47 
 
 
639 aa  147  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  31.89 
 
 
668 aa  138  3e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  32.65 
 
 
658 aa  137  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  28.98 
 
 
583 aa  133  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  33.17 
 
 
676 aa  132  1e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  30 
 
 
643 aa  132  2e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  29.93 
 
 
557 aa  132  2e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  31.38 
 
 
644 aa  130  5e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  29.31 
 
 
645 aa  129  2e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.47 
 
 
676 aa  128  2e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  29.41 
 
 
556 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  25.5 
 
 
710 aa  126  8e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  28.38 
 
 
566 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  28.03 
 
 
550 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  28.82 
 
 
701 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  30.68 
 
 
636 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  28.78 
 
 
642 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  27.67 
 
 
564 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  28.69 
 
 
550 aa  122  1e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  28.32 
 
 
671 aa  122  2e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  27.57 
 
 
557 aa  121  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.49 
 
 
690 aa  120  5e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.95 
 
 
682 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.61 
 
 
687 aa  120  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.63 
 
 
682 aa  119  1e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1125  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.49 
 
 
714 aa  118  2e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875999  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  30.87 
 
 
681 aa  118  2e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.47 
 
 
676 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  27.91 
 
 
560 aa  117  4e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.68 
 
 
690 aa  117  4e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.87 
 
 
683 aa  117  4e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  25.59 
 
 
708 aa  116  1e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.77 
 
 
692 aa  115  2e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  29.6 
 
 
715 aa  113  7e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  27.7 
 
 
641 aa  113  7e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.52 
 
 
712 aa  113  7e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.140171 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  26.92 
 
 
638 aa  113  8e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  31.25 
 
 
675 aa  113  8e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  31.25 
 
 
675 aa  113  8e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  32.12 
 
 
570 aa  112  2e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  28.98 
 
 
553 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  28.53 
 
 
715 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  26.46 
 
 
572 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  30 
 
 
667 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  29.51 
 
 
575 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  28.97 
 
 
706 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.53 
 
 
694 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4041  hydantoinase  31.21 
 
 
374 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711164  decreased coverage  0.0015292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5342  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.61 
 
 
699 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  29.3 
 
 
579 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3307  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.96 
 
 
673 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.593183  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.67 
 
 
706 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  29.64 
 
 
679 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.09 
 
 
674 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  28.2 
 
 
680 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.35 
 
 
684 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.41 
 
 
687 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1559  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.4 
 
 
680 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63787  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  24.51 
 
 
553 aa  100  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7016  hydantoin utilization protein  29.2 
 
 
673 aa  100  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626492  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.83 
 
 
692 aa  100  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.41 
 
 
694 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.49 
 
 
702 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6223  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.61 
 
 
690 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220681  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.33 
 
 
690 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.93 
 
 
680 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.35 
 
 
765 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.78 
 
 
707 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>