178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0090 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
198 aa  399  1e-110  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
262 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 
250 aa  107  9e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  34.5 
 
 
250 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  36.93 
 
 
261 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  34.5 
 
 
250 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.96102e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  34.5 
 
 
250 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  34.5 
 
 
250 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  34.5 
 
 
250 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  33.92 
 
 
250 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  34.5 
 
 
250 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
250 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  37.95 
 
 
253 aa  97.1  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 
266 aa  97.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  33.15 
 
 
299 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  32.42 
 
 
238 aa  88.6  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  26.95 
 
 
287 aa  84.3  1e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 
283 aa  83.2  2e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  38.65 
 
 
266 aa  82  5e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  35.43 
 
 
262 aa  81.6  7e-15  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  32.6 
 
 
282 aa  79  4e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 
235 aa  77  2e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  32.94 
 
 
253 aa  76.6  2e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  33.54 
 
 
249 aa  75.5  5e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  36.69 
 
 
278 aa  75.1  6e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  36.69 
 
 
278 aa  75.1  6e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  36.69 
 
 
278 aa  75.1  6e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 
276 aa  72  5e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  32.31 
 
 
271 aa  70.9  1e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 
284 aa  70.5  2e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 
269 aa  70.5  2e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 
284 aa  70.1  2e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09027  conserved hypothetical protein  31.15 
 
 
279 aa  69.3  4e-11  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  33.55 
 
 
237 aa  68.2  8e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  34.12 
 
 
283 aa  66.6  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  31.64 
 
 
268 aa  65.5  5e-10  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0941  beta-lactamase domain-containing protein  31.74 
 
 
185 aa  64.3  1e-09  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.95 
 
 
266 aa  63.9  2e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 
284 aa  62  6e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3485  AHL-lactonase  36.56 
 
 
94 aa  61.2  8e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 
269 aa  61.2  9e-09  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  37.84 
 
 
284 aa  60.8  1e-08  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  35.04 
 
 
263 aa  60.5  1e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  30.26 
 
 
271 aa  60.5  2e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_003296  RS03884  hypothetical protein  39 
 
 
136 aa  60.5  2e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.762573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  32.03 
 
 
308 aa  60.5  2e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 
291 aa  59.3  3e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  29.57 
 
 
282 aa  59.3  3e-08  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
298 aa  59.3  4e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1316  beta-lactamase domain protein  30.64 
 
 
263 aa  58.9  5e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  29.24 
 
 
279 aa  58.5  6e-08  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 
267 aa  58.5  6e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 
284 aa  58.5  7e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 
266 aa  58.5  7e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 
243 aa  57.8  1e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 
235 aa  57.8  1e-07  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  27.32 
 
 
294 aa  56.6  2e-07  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 
302 aa  55.1  8e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  35.25 
 
 
288 aa  54.7  9e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  34.53 
 
 
288 aa  53.9  1e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  31.3 
 
 
327 aa  53.9  1e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  23.35 
 
 
233 aa  54.3  1e-06  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  28.19 
 
 
266 aa  54.3  1e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 
297 aa  53.5  2e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 
280 aa  53.5  2e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 
285 aa  53.1  3e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 
271 aa  52.4  4e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 
312 aa  52.4  5e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  30.46 
 
 
281 aa  52  5e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  25.73 
 
 
284 aa  51.6  8e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 
229 aa  51.6  8e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  35.24 
 
 
282 aa  51.2  9e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 
285 aa  51.2  1e-05  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 
210 aa  50.8  1e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.82 
 
 
288 aa  50.1  2e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  29.65 
 
 
276 aa  49.7  2e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  30.94 
 
 
300 aa  49.3  3e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 
269 aa  49.7  3e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  33.86 
 
 
315 aa  49.7  3e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 
303 aa  49.3  3e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3579  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 
273 aa  49.7  3e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00371126  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
248 aa  49.3  4e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  33.93 
 
 
322 aa  49.3  4e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0540  beta-lactamase-like protein  26.67 
 
 
273 aa  48.9  4e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 
248 aa  49.3  4e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 
318 aa  49.3  4e-05  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  27.78 
 
 
210 aa  48.9  5e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  26.45 
 
 
248 aa  48.5  6e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 
301 aa  48.5  7e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 
294 aa  48.5  7e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  27.33 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2307  hypothetical protein  30.36 
 
 
368 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.35392e-05  normal  0.0472495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  26.78 
 
 
293 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  33.87 
 
 
311 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  26.53 
 
 
337 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 
311 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0442  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  1.84233e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  33.94 
 
 
278 aa  47.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 
293 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>