77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0083 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  221  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  65 
 
 
85 aa  97.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  56.96 
 
 
95 aa  94  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  2.77826e-05  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  55.7 
 
 
85 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  51.16 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  38.38 
 
 
110 aa  73.6  8e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  38.38 
 
 
110 aa  73.6  8e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  38.38 
 
 
110 aa  73.6  8e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  37.37 
 
 
110 aa  72  3e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  38.38 
 
 
110 aa  71.2  4e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  39.29 
 
 
110 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  42.57 
 
 
469 aa  69.3  2e-11  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  38.1 
 
 
110 aa  67.8  5e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  45.59 
 
 
103 aa  67.8  5e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  37 
 
 
110 aa  67  8e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.26 
 
 
478 aa  66.6  1e-10  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  40.54 
 
 
103 aa  66.6  1e-10  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.86283e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  40.51 
 
 
118 aa  64.3  5e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  37.36 
 
 
99 aa  63.2  1e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 
983 aa  62  3e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  36.14 
 
 
108 aa  61.6  3e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  38.75 
 
 
130 aa  60.1  1e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  37.5 
 
 
102 aa  59.7  1e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  37.88 
 
 
97 aa  59.7  1e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  35.9 
 
 
98 aa  59.7  1e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  44.12 
 
 
107 aa  58.2  4e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  39.19 
 
 
104 aa  58.2  4e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  38.55 
 
 
98 aa  58.2  4e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  41.1 
 
 
96 aa  58.2  4e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  35.9 
 
 
99 aa  57.8  5e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  39.56 
 
 
984 aa  57  8e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  32.98 
 
 
99 aa  55.8  2e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31610  hypothetical protein  48.15 
 
 
87 aa  53.9  7e-07  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  32.91 
 
 
98 aa  53.1  1e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.03 
 
 
429 aa  52.4  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  47.37 
 
 
84 aa  52.4  2e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  37.97 
 
 
99 aa  52.4  2e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.31 
 
 
429 aa  52.4  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  36.71 
 
 
99 aa  52  3e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  36.71 
 
 
99 aa  52  3e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.03 
 
 
429 aa  52  3e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  35.29 
 
 
99 aa  51.2  5e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  32.94 
 
 
98 aa  50.1  9e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5995  hypothetical protein  42.22 
 
 
99 aa  50.1  1e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532298  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  39.44 
 
 
115 aa  49.7  1e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  37.88 
 
 
960 aa  49.3  2e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.62 
 
 
452 aa  49.3  2e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  40.62 
 
 
123 aa  48.1  4e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  32.94 
 
 
104 aa  48.1  4e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  37.5 
 
 
126 aa  47.8  5e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2501  sarcosine oxidase alpha subunit  33.78 
 
 
80 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.295491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  32.94 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  37.88 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  36.36 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.05 
 
 
591 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  36.9 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  34.52 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.78 
 
 
452 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  37.14 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  34.25 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.8 
 
 
967 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  34.85 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  31.51 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  31.51 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  36.11 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  34.43 
 
 
128 aa  42  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  34.85 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  31.96 
 
 
96 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  28.24 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  32.88 
 
 
114 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30.26 
 
 
987 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  33.33 
 
 
968 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  34.72 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  33.85 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>