217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0081 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 
327 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  37.5 
 
 
335 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  31.8 
 
 
323 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  32.12 
 
 
323 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  34.3 
 
 
323 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  31.79 
 
 
323 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  32.12 
 
 
323 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  32.12 
 
 
323 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  32.12 
 
 
323 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  36.19 
 
 
323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  31.79 
 
 
323 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  33.2 
 
 
317 aa  155  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  31.79 
 
 
323 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  32.34 
 
 
323 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  32.34 
 
 
323 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  32.34 
 
 
323 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  32.34 
 
 
323 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  32.34 
 
 
323 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  31.46 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  34.8 
 
 
313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  32.21 
 
 
332 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  32.34 
 
 
323 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  32.34 
 
 
323 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  32.67 
 
 
328 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  32.3 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  30.36 
 
 
323 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  31.96 
 
 
323 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  30.36 
 
 
323 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  32.34 
 
 
328 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  34.75 
 
 
332 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  36.9 
 
 
307 aa  149  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  31.46 
 
 
325 aa  149  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  32.12 
 
 
323 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  32.4 
 
 
311 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  28.38 
 
 
324 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  30.46 
 
 
325 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  30.19 
 
 
326 aa  142  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  29.79 
 
 
325 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  30.79 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  30.46 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  29.79 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  29.79 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  29.79 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  29.45 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  30.57 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  29.79 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  31.76 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  32.8 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  30.21 
 
 
357 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  33.33 
 
 
315 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  32.02 
 
 
325 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  27.48 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  32.93 
 
 
333 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  29.49 
 
 
336 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  29.35 
 
 
328 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  33.54 
 
 
333 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  33.97 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  30.8 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  37.1 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  37.63 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  37.1 
 
 
307 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  34.72 
 
 
307 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  34.72 
 
 
307 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  34.72 
 
 
307 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  37.1 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  32.8 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  36.56 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  37.1 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  35.12 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  30 
 
 
386 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  36.47 
 
 
350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.37 
 
 
602 aa  129  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  30.1 
 
 
381 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  35.48 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  31.4 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  35.51 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  26.09 
 
 
327 aa  126  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  26.07 
 
 
329 aa  125  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  31.3 
 
 
377 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  30.03 
 
 
328 aa  125  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  31.45 
 
 
306 aa  125  9e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  28.66 
 
 
332 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  30.77 
 
 
311 aa  123  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  25.41 
 
 
329 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  32.95 
 
 
399 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  24.75 
 
 
329 aa  123  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  27.73 
 
 
329 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  32.11 
 
 
307 aa  122  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  33.77 
 
 
345 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  32.32 
 
 
412 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  33.44 
 
 
345 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  32.41 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  30.85 
 
 
352 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  32.7 
 
 
354 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  34.1 
 
 
338 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  30.86 
 
 
438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  32.44 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  30.51 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  35.71 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  25.17 
 
 
346 aa  119  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>