More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0076 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0076  ABC transporter related  100 
 
 		 507 aa  986    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3644  ABC transporter related  58.62 
 
 		 508 aa  547  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4122  ABC transporter related protein  50.92 
 
 		 510 aa  431  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.885223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2215  ABC transporter related protein  48.88 
 
 		 501 aa  401  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  47.54 
 
 		 504 aa  402  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1050  ABC transporter related  44.42 
 
 		 510 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.322688  normal  0.0473655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  48.96 
 
 		 508 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  47.13 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  45.45 
 
 		 492 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  47.38 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  42.15 
 
 		 519 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  45.13 
 
 		 492 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  45.91 
 
 		 498 aa  364  2e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  43.35 
 
 		 513 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  42.89 
 
 		 524 aa  362  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46 
 
 		 499 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  43.5 
 
 		 505 aa  361  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  41.56 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 499 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.01 
 
 		 507 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  42.26 
 
 		 524 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.63 
 
 		 497 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  40.92 
 
 		 497 aa  360  5e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  42.26 
 
 		 524 aa  359  8e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  43.1 
 
 		 507 aa  358  9e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.05 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.47 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  42.05 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 		 499 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  43.1 
 
 		 507 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  42.32 
 
 		 517 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  39.17 
 
 		 520 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  39.17 
 
 		 509 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.84 
 
 		 527 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  39.06 
 
 		 500 aa  355  6.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  38.79 
 
 		 495 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 510 aa  355  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0822  ABC transporter related  38.12 
 
 		 502 aa  354  2e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.688061  hitchhiker  0.00171866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  40.37 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  36.96 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  42.68 
 
 		 518 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.34 
 
 		 495 aa  353  4e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  45.66 
 
 		 500 aa  353  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  43.37 
 
 		 506 aa  353  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  43.5 
 
 		 506 aa  353  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  44.76 
 
 		 506 aa  353  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.94 
 
 		 506 aa  352  8e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  40.24 
 
 		 503 aa  352  8e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.74 
 
 		 503 aa  352  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  43.31 
 
 		 521 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  40.57 
 
 		 501 aa  352  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40.33 
 
 		 501 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 501 aa  351  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  40.33 
 
 		 501 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 		 506 aa  351  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  40.33 
 
 		 501 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  40.33 
 
 		 501 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2683  ABC transporter related  45.91 
 
 		 499 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.28 
 
 		 506 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.81 
 
 		 506 aa  350  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  43.28 
 
 		 495 aa  350  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  41.7 
 
 		 522 aa  350  5e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  42.07 
 
 		 518 aa  349  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  41.76 
 
 		 525 aa  349  6e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  39.79 
 
 		 516 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  40.99 
 
 		 511 aa  349  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  42.71 
 
 		 528 aa  349  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  41.42 
 
 		 516 aa  349  7e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  39.79 
 
 		 516 aa  349  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  39.55 
 
 		 516 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.66 
 
 		 518 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  40.37 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.76 
 
 		 492 aa  348  1e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  39.55 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  40.12 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2810  ABC transporter related  43.34 
 
 		 513 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  40.52 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  39.63 
 
 		 516 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1459  ABC transporter related  44.79 
 
 		 512 aa  348  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5464  ABC transporter related  42.56 
 
 		 506 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3548  ABC transporter related  42.56 
 
 		 506 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650239  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2783  ABC transporter related  43.34 
 
 		 513 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  43.67 
 
 		 519 aa  348  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  39.35 
 
 		 502 aa  348  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  40.66 
 
 		 502 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  42.56 
 
 		 506 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2827  ABC transporter related  43.34 
 
 		 513 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877357  normal  0.0187049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  42.51 
 
 		 506 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  42.53 
 
 		 497 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40.25 
 
 		 494 aa  347  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  40.2 
 
 		 501 aa  347  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  39.19 
 
 		 500 aa  347  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  42.13 
 
 		 503 aa  347  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  40.49 
 
 		 513 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  35.64 
 
 		 493 aa  346  5e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2907  ABC transporter related  44.96 
 
 		 499 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  42.22 
 
 		 523 aa  346  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  42.42 
 
 		 512 aa  346  6e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  40.53 
 
 		 501 aa  346  6e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  44.97 
 
 		 505 aa  346  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>