289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0072 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0072  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 306 aa  594  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  51.06 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  48.68 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  53.09 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  42.38 
 
 		 320 aa  168  8e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  36.02 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  36.78 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  36.78 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  36.4 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  36.78 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  35.5 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  34.48 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  34.48 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  35.34 
 
 		 325 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  35.25 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  32.05 
 
 		 323 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  31.66 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  38.26 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  38.64 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  31.19 
 
 		 324 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  39.46 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  28.85 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.22 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  29.11 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  35.86 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  30.55 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  30.35 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  30.19 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.69 
 
 		 348 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  32.39 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  32.65 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  36.95 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  29.52 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  36.22 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  32.35 
 
 		 466 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  32.13 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.94 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  27.16 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  33.58 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  35.33 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  34.83 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  35.85 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  36.7 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.19 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  30.37 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  35.11 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 316 aa  96.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.92 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36 
 
 		 321 aa  95.9  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  34.81 
 
 		 320 aa  95.9  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.45 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  30.91 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  31.56 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  34.54 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  27.44 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  31.75 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  34.34 
 
 		 330 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1663  ornithine cyclodeaminase  34.46 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037866  normal  0.0691504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  28.21 
 
 		 327 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  33.85 
 
 		 310 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  26.77 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  27.1 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  29.07 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  30.35 
 
 		 317 aa  92.4  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.73 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  34.75 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  31.82 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  35.85 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4240  ornithine cyclodeaminase  34.46 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00241328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.11 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  32.98 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  28.24 
 
 		 359 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3766  ornithine cyclodeaminase  35.14 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  31.2 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2152  ornithine cyclodeaminase  35.66 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  28.26 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  33.8 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  30.08 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  36.78 
 
 		 315 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  32.95 
 
 		 322 aa  89.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.98 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  36.25 
 
 		 329 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  28.96 
 
 		 358 aa  85.9  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  31.39 
 
 		 328 aa  85.9  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  27.41 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5997  ornithine cyclodeaminase  33.98 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  32.4 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  32.53 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  29.88 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  32.57 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  34.11 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.16 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  33.49 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>