More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0071 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0071  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
155 aa  314  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3658  AsnC family transcriptional regulator  73.83 
 
 
149 aa  229  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.45 
 
 
150 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.05 
 
 
150 aa  143  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  53.91 
 
 
134 aa  140  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 
152 aa  140  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  3.19505e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 
150 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 
150 aa  126  1e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 
150 aa  126  1e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 
150 aa  125  2e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 
151 aa  125  2e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
151 aa  124  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  44.22 
 
 
151 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
153 aa  119  1e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  43.45 
 
 
150 aa  118  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 
154 aa  116  1e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
174 aa  114  4e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 
150 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
154 aa  114  7e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 
158 aa  113  8e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
150 aa  113  1e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
155 aa  112  1e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40.56 
 
 
152 aa  110  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 
157 aa  110  7e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
154 aa  110  8e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 
158 aa  109  1e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
157 aa  109  2e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  41.78 
 
 
154 aa  108  2e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
156 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
157 aa  108  4e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
152 aa  107  4e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
156 aa  108  4e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 
157 aa  108  4e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 
181 aa  108  4e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
152 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 
156 aa  107  7e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 
153 aa  106  9e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 
156 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
155 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
159 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
155 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
157 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
152 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
152 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  38.46 
 
 
152 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
154 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
152 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
177 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 
150 aa  103  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
158 aa  103  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
153 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 
155 aa  103  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 
145 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
152 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
160 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 
157 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 
157 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 
166 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
153 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  37.42 
 
 
162 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
166 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  37.42 
 
 
162 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  37.11 
 
 
171 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  37.42 
 
 
162 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 
164 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
153 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
165 aa  101  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
157 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 
164 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
180 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
155 aa  100  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  37.76 
 
 
152 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  37.76 
 
 
152 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  37.76 
 
 
152 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
153 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 
153 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
159 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
175 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
159 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.06 
 
 
153 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
154 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
156 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
155 aa  98.6  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  35.62 
 
 
229 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  1.3017e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 
167 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  37.06 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  34.25 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.8296e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
156 aa  98.2  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.19 
 
 
167 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>