More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0070 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0070  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
207 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3659  lysine exporter protein LysE/YggA  51.94 
 
 
233 aa  185  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3736  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.86 
 
 
206 aa  128  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7985  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.38 
 
 
209 aa  124  8e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46450  Transporter, LysE family  41.83 
 
 
205 aa  120  1e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0182  amino acid transporter LysE  44.93 
 
 
205 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3990  lysine exporter protein LysE/YggA  40.67 
 
 
216 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0428  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.93 
 
 
204 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2250  lysine exporter protein LysE/YggA  41.63 
 
 
204 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.233575  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3653  amino acid transporter LysE  41.55 
 
 
204 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2077  lysine exporter protein LysE/YggA  41.55 
 
 
204 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3513  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 
205 aa  101  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0702628  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3769  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.79 
 
 
215 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2254  lysine exporter protein LysE/YggA  40.58 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.675856 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0074  LysE family amino acid efflux protein  32.02 
 
 
274 aa  91.7  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0116  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 
208 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 
212 aa  88.6  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 
203 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  35.5 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  37 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  36.84 
 
 
215 aa  85.9  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
204 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 
219 aa  85.1  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  36.5 
 
 
208 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.84 
 
 
207 aa  84.3  1e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  36.5 
 
 
208 aa  84  1e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  36.5 
 
 
208 aa  84  1e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  35.4 
 
 
194 aa  83.2  2e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  35.4 
 
 
194 aa  83.2  2e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  37 
 
 
242 aa  83.6  2e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  34.85 
 
 
204 aa  83.6  2e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  35.4 
 
 
194 aa  83.2  2e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  35.4 
 
 
194 aa  83.2  2e-15  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 
209 aa  83.2  3e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 
209 aa  82.4  4e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 
209 aa  82.4  4e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.86 
 
 
211 aa  82.4  4e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.54 
 
 
207 aa  82  6e-15  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  34.34 
 
 
204 aa  82  6e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  34.34 
 
 
204 aa  81.6  7e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  34.34 
 
 
204 aa  81.6  7e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  31.37 
 
 
210 aa  80.9  1e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  30.88 
 
 
210 aa  81.3  1e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  30.88 
 
 
210 aa  80.5  1e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  31.37 
 
 
210 aa  80.9  1e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  30.88 
 
 
210 aa  80.5  1e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87844e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  28.64 
 
 
213 aa  79.7  2e-14  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  31.37 
 
 
210 aa  79.7  3e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  40.74 
 
 
218 aa  79.3  3e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  31.37 
 
 
210 aa  79.7  3e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.97 
 
 
207 aa  79.7  3e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.36 
 
 
218 aa  79  4e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
211 aa  79  4e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  41.54 
 
 
211 aa  79.3  4e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 
209 aa  79  5e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33 
 
 
208 aa  79  5e-14  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.23 
 
 
218 aa  78.2  7e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  34.78 
 
 
208 aa  78.2  7e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  34.45 
 
 
207 aa  78.2  8e-14  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.35 
 
 
208 aa  78.2  9e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  35.22 
 
 
207 aa  78.2  9e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  36.76 
 
 
212 aa  78.2  9e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
227 aa  77.8  1e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 
207 aa  77.8  1e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  35.9 
 
 
213 aa  77.4  1e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
204 aa  77.4  1e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  30.88 
 
 
210 aa  77.8  1e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  35.22 
 
 
207 aa  77.8  1e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.68 
 
 
208 aa  77  2e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
204 aa  76.6  2e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.13 
 
 
208 aa  76.6  2e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  37.75 
 
 
211 aa  77  2e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  2.85135e-07 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
205 aa  77  2e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4362  lysine exporter protein LysE/YggA  37.91 
 
 
211 aa  76.3  3e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 
204 aa  76.6  3e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  29.76 
 
 
208 aa  76.3  3e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.94 
 
 
211 aa  76.3  3e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 
204 aa  76.3  3e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 
209 aa  76.6  3e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 
206 aa  76.3  3e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.91 
 
 
234 aa  75.9  4e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  37.07 
 
 
209 aa  75.9  4e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  34.76 
 
 
209 aa  75.9  4e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
204 aa  75.5  5e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  37.75 
 
 
203 aa  75.5  5e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
204 aa  75.1  6e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.04 
 
 
211 aa  75.1  6e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.51 
 
 
204 aa  75.1  7e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 
208 aa  75.1  7e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 
208 aa  75.1  7e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.81 
 
 
208 aa  75.1  7e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
209 aa  75.1  7e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 
208 aa  75.1  8e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  35.88 
 
 
209 aa  74.7  9e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4486  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.46 
 
 
211 aa  74.3  1e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5121  hypothetical protein  35.9 
 
 
210 aa  73.9  1e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  35.92 
 
 
206 aa  73.9  1e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>