More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0065 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  78.9 
 
 
437 aa  699  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  78.9 
 
 
437 aa  699  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66902e-13 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  79.7 
 
 
474 aa  746  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  78.9 
 
 
437 aa  699  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  100 
 
 
479 aa  966  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  100 
 
 
479 aa  966  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  100 
 
 
479 aa  966  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  79.12 
 
 
480 aa  769  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  79.66 
 
 
414 aa  671  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  70.19 
 
 
465 aa  645  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  87.39 
 
 
453 aa  810  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  79.12 
 
 
480 aa  769  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  78.9 
 
 
437 aa  699  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  79.7 
 
 
474 aa  746  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  79.7 
 
 
474 aa  746  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  66.01 
 
 
465 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  66.01 
 
 
465 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  66.01 
 
 
465 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  66.01 
 
 
465 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  66.01 
 
 
465 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  65.8 
 
 
465 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  66.01 
 
 
465 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  63.72 
 
 
466 aa  575  1e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  58.53 
 
 
466 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  58.53 
 
 
466 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  58.53 
 
 
466 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  58.53 
 
 
466 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  58.53 
 
 
466 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  58.53 
 
 
466 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  58.53 
 
 
466 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  58.53 
 
 
466 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  58.53 
 
 
466 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  58.53 
 
 
466 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  58.53 
 
 
466 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  58.53 
 
 
466 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  58.53 
 
 
466 aa  506  1e-142  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  58.98 
 
 
481 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  58.96 
 
 
402 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0476  IS30 family transposase  58.47 
 
 
300 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  44.99 
 
 
385 aa  308  2e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  44.99 
 
 
385 aa  307  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  45.36 
 
 
457 aa  303  3e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  45.36 
 
 
457 aa  303  3e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  45.36 
 
 
457 aa  303  3e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  45.36 
 
 
457 aa  303  3e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  45.36 
 
 
457 aa  303  3e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  45.36 
 
 
457 aa  303  3e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  45.36 
 
 
457 aa  303  3e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  45.36 
 
 
457 aa  303  3e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  45.36 
 
 
457 aa  303  3e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  45.36 
 
 
457 aa  303  3e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  44.53 
 
 
326 aa  296  5e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  45.89 
 
 
496 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  45.89 
 
 
519 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  45.89 
 
 
525 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  45.89 
 
 
519 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  45.89 
 
 
519 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  45.62 
 
 
519 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  45.62 
 
 
519 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  40.27 
 
 
385 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23291e-09 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  40.09 
 
 
385 aa  286  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  44.83 
 
 
342 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  43.62 
 
 
386 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  43.62 
 
 
386 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  43.47 
 
 
386 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  42.46 
 
 
423 aa  275  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  42.46 
 
 
423 aa  275  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  42.46 
 
 
423 aa  275  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  42.46 
 
 
423 aa  275  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  42.46 
 
 
423 aa  275  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  39.41 
 
 
385 aa  275  1e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  40.86 
 
 
380 aa  273  6e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  43.5 
 
 
386 aa  272  8e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  42.71 
 
 
386 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  43.24 
 
 
386 aa  271  3e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  42.48 
 
 
409 aa  270  6e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  40.36 
 
 
380 aa  268  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  43.62 
 
 
421 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  43.75 
 
 
386 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  42.22 
 
 
339 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
339 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
339 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  41.82 
 
 
386 aa  262  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 
386 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  38.44 
 
 
408 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  42.71 
 
 
334 aa  260  5e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  42.71 
 
 
334 aa  260  5e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  38.62 
 
 
401 aa  259  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  42.44 
 
 
334 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 
401 aa  256  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  40.73 
 
 
356 aa  255  1e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  38.74 
 
 
399 aa  255  1e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  40.73 
 
 
356 aa  255  1e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  38.74 
 
 
399 aa  255  1e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  39.59 
 
 
383 aa  253  4e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  39.34 
 
 
383 aa  253  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  39.34 
 
 
383 aa  252  9e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  39.34 
 
 
383 aa  252  9e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  39.34 
 
 
383 aa  252  9e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  39.34 
 
 
383 aa  252  9e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>