More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0063 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0063  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
109 aa  217  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1203  transposase IS3/IS911 family protein  58.88 
 
 
109 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215e-31  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.60134e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.83836e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  5.69119e-10 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  1.33913e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.32462e-61  hitchhiker  3.85538e-06 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.90983e-43  hitchhiker  7.5724e-10 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.02607e-05  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.37726e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  8.0045e-09 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  61.17 
 
 
108 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2529  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 
108 aa  115  2e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  3.11757e-07  hitchhiker  0.00296744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3607  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 
108 aa  115  2e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00876611  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3482  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 
108 aa  115  2e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265992  hitchhiker  0.00308131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2223  transposase IS3/IS911 family protein  61.45 
 
 
89 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.055564  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2045  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
89 aa  103  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00952003  normal  0.01022 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5443  transposase IS3/IS911 family protein  53 
 
 
108 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181407  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5601  transposase IS3/IS911  52 
 
 
108 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6002  transposase IS3/IS911 family protein  52 
 
 
108 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  7.11123e-12 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  53.7 
 
 
105 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  53.7 
 
 
105 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1239  transposase IS3/IS911 family protein  55.32 
 
 
111 aa  100  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5829  transposase IS3/IS911 family protein  52 
 
 
121 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.342164 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5432  transposase IS3/IS911  52 
 
 
121 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.115544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  51.85 
 
 
105 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  53.33 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  52.34 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  52.34 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  50.47 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  51.85 
 
 
105 aa  94  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  50.47 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4729  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  49.53 
 
 
107 aa  92  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  50.47 
 
 
107 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  50.47 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2800  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0137371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2657  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0366  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0818  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0713  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1174  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2668  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1178  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1740  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4659  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2587  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0365  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  50.94 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  50.94 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  48.6 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  48.6 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  48.6 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  51.46 
 
 
112 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  51.46 
 
 
109 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5654  transposase IS3/IS911 family protein  48.51 
 
 
104 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238743  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  51.46 
 
 
112 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5988  transposase IS3/IS911 family protein  48.51 
 
 
104 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000845611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  51.46 
 
 
109 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  51.46 
 
 
109 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1591  transposase IS3/IS911 family protein  50.5 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3564  transposase IS3/IS911 family protein  50.5 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2032  transposase IS3/IS911 family protein  50.5 
 
 
106 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1092  transposase IS3/IS911 family protein  50.5 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0571  transposase IS3/IS911 family protein  50.5 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2447  transposase IS3/IS911 family protein  46.73 
 
 
108 aa  87.8  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000211632  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1221  transposase IS3/IS911 family protein  44.86 
 
 
108 aa  87  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.774632  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1223  transposase IS3/IS911 family protein  44.86 
 
 
108 aa  87  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16285  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  52 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4623  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0223543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4236  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4081  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1894  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310472  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0742  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0381  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1403  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0600  Fis family transcriptional regulator  45.63 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981407  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2593  transposase IS3/IS911  45.63 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214558  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0929  transposase IS3/IS911  45.63 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0946  Fis family transcriptional regulator  45.63 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1483  Fis family transcriptional regulator  45.63 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2637  Fis family transcriptional regulator  45.63 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470517  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25110  Transposase  48.6 
 
 
106 aa  84.3  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3287  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  48.6 
 
 
108 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  52.43 
 
 
108 aa  81.3  4e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13980  Transposase  43.69 
 
 
114 aa  80.9  5e-15  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
107 aa  81.3  5e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  45.63 
 
 
108 aa  80.9  6e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  45.79 
 
 
108 aa  80.5  7e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
110 aa  80.1  9e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
110 aa  80.1  9e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>