More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0061 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
297 aa  592  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
281 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
284 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
280 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  33.56 
 
 
303 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
294 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0067  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.78 
 
 
295 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
294 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
278 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
278 aa  155  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
275 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
279 aa  152  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
285 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
281 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224694  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
277 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.28 
 
 
297 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
288 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
291 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
316 aa  148  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6935  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
303 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
279 aa  145  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
279 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
287 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.12 
 
 
276 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.828471  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
275 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
296 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
271 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.19 
 
 
292 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01530  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.3 
 
 
276 aa  142  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
284 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.290341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7705  sugar ABC transporter (permease)  31.68 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.78 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.21 
 
 
283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
276 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3249  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.06 
 
 
284 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
295 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
283 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
281 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.13099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.83 
 
 
298 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
283 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
276 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00701283  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
276 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.776984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
306 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
291 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3943  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.2 
 
 
281 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0114669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
289 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
279 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
283 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
283 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.674911  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
271 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
291 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  29.76 
 
 
278 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.019409  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
299 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
277 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2049  sugar ABC transporter (permease)  32.62 
 
 
303 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907779  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  33.68 
 
 
286 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
293 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
288 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
281 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  34.88 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
285 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
279 aa  135  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.468941  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  hitchhiker  0.000196491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.21 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29430  ABC-type sugar transport system, permease component  32.6 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  0.943286 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  29.23 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  29.23 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  29.23 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  29.23 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
288 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
282 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437147  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
275 aa  132  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.741227  normal  0.869108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
298 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24640  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.6 
 
 
303 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>