More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0059 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
439 aa  889  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 
417 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
420 aa  96.3  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 
435 aa  93.2  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  30.39 
 
 
427 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.97 
 
 
426 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 
470 aa  90.1  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 
441 aa  86.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 
444 aa  85.1  2e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.99953e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  22.44 
 
 
424 aa  85.5  2e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 
414 aa  84.7  3e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.06 
 
 
416 aa  84  5e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25 
 
 
427 aa  83.6  6e-15  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.7 
 
 
416 aa  82.4  1e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 
455 aa  82  2e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 
451 aa  82  2e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 
435 aa  81.3  4e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
422 aa  80.9  4e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 
446 aa  80.5  5e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.58 
 
 
441 aa  80.1  7e-14  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 
431 aa  80.1  8e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28.87 
 
 
434 aa  79.7  9e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 
448 aa  79.3  1e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 
428 aa  78.2  3e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
429 aa  77.4  5e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 
452 aa  77  6e-13  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
468 aa  77  6e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
428 aa  76.6  7e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.53 
 
 
428 aa  76.6  8e-13  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 
442 aa  75.9  1e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 
441 aa  76.3  1e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.2 
 
 
399 aa  75.1  2e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  31.88 
 
 
446 aa  75.1  2e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  23.2 
 
 
413 aa  75.5  2e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 
451 aa  75.1  3e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  5.53575e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 
432 aa  74.7  3e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 
422 aa  73.9  6e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.03 
 
 
434 aa  73.9  6e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.32 
 
 
406 aa  73.2  9e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 
445 aa  73.2  9e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 
459 aa  73.2  1e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 
431 aa  72.8  1e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  2.38529e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4609  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 
427 aa  72.4  2e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.96 
 
 
435 aa  72  2e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 
495 aa  71.2  3e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 
426 aa  71.2  3e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 
420 aa  71.2  4e-11  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 
442 aa  70.5  5e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 
456 aa  70.5  5e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
419 aa  70.5  5e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 
431 aa  70.5  6e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 
441 aa  70.1  8e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 
424 aa  69.7  1e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 
425 aa  69.3  1e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  25.91 
 
 
428 aa  69.3  1e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  32.91 
 
 
420 aa  68.6  2e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.18 
 
 
441 aa  68.9  2e-10  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.51 
 
 
434 aa  68.9  2e-10  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 
435 aa  67.4  4e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 
433 aa  67.8  4e-10  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  26.94 
 
 
437 aa  67  6e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  29.15 
 
 
487 aa  67  6e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.88 
 
 
457 aa  66.6  8e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.62 
 
 
426 aa  66.6  9e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 
445 aa  66.6  9e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 
493 aa  65.9  1e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 
451 aa  65.9  1e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 
427 aa  66.2  1e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 
408 aa  65.1  2e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
414 aa  65.1  2e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 
432 aa  64.7  3e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  23.4 
 
 
410 aa  64.7  3e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
455 aa  64.3  4e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  21.61 
 
 
446 aa  64.3  5e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 
408 aa  63.9  6e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.92518e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
393 aa  63.5  7e-09  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 
433 aa  63.2  9e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  4.88029e-05  hitchhiker  1.84856e-05 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 
446 aa  62.8  1e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 
434 aa  62.8  1e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 
441 aa  62  2e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.27 
 
 
408 aa  62  2e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  24.04 
 
 
426 aa  62.4  2e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
440 aa  61.6  2e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 
417 aa  62  2e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 
417 aa  62  2e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 
454 aa  62  2e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 
439 aa  61.2  3e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
458 aa  61.6  3e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
455 aa  61.2  3e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 
434 aa  61.2  3e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 
436 aa  61.2  4e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3365  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 
455 aa  60.8  4e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.079846  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.35 
 
 
484 aa  60.8  5e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  20.58 
 
 
442 aa  60.5  6e-08  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 
434 aa  60.5  6e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 
440 aa  60.5  6e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 
458 aa  60.1  7e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 
410 aa  59.7  9e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 
422 aa  60.1  9e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>